2017-01-25 5 views
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-metator-パッケージ内の-forest-コマンドで表示される情報に(何らかの形で)アクセスできるかどうかは疑問です。meta-analysisのメタフォールフォレストプロットからの情報へのアクセス/保存

私は結果を確認/検証しており、生成された値の出力をしたいと思います。これまでのところ、すべての計算がチェックされていますが、手作業で入力するのではなく、印刷、保存などに利用できるようにしたいと考えています。

サンプルコードは、以下である:


es <- read.table(header=TRUE, text = " 
b se_b 
0.083 0.011 
0.114 0.011 
0.081 0.013 
0.527 0.017 
") 


library(metafor) 

es.est <- rma(yi=b, sei=se_b, dat=es, method="DL") 


studies <- as.vector( c("Larry (2011)" , "Curly (2011)", "Moe (2015)" , "Shemp (2010)") ) 


forest(es.est , transf=exp , slab = studies , refline = 1 , xlim=c(0,3), at = c(1, 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5, 4) , showweights=TRUE) 

Iの値(エフェクトサイズと各研究のためにCI、ならびに全体的な推定値、及びCI)にアクセスしたいことグラフィックの右側に表示されます。

本当にありがとうございました、

-Jon

答えて

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方法について:

> summary(escalc(measure="GEN", yi=b, sei=se_b, data=es), transf=exp) 
     b se_b  yi  vi sei  zi ci.lb ci.ub 
1 0.083 0.011 1.0865 0.0001 0.0110 7.5455 1.0634 1.1102 
2 0.114 0.011 1.1208 0.0001 0.0110 10.3636 1.0968 1.1452 
3 0.081 0.013 1.0844 0.0002 0.0130 6.2308 1.0571 1.1124 
4 0.527 0.017 1.6938 0.0003 0.0170 31.0000 1.6383 1.7512 

その後yici.lb、およびci.ubが同じ情報を提供します。

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鮮やかな...私は - エスカルカルが関係していると思ったが、どのように理解できなかったか... –

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