gzfileで `data.table`からfwriteを使うことはできますか？

Question

私はsshサーバでRセッションを実行していますが、ストレージ容量は限られています。圧縮を可能にするfwriteの実装があるかどうか疑問に思っていましたか？ような何か：

z <- gzfile("file.csv.gz) 
fwrite(object, z) 

Answer 1

data.table::fwriteは接続をサポートしていません。データを実際に追加する必要がある場合は、iotools::write.csv.rawにgzfile接続を使用してください。それ以外の場合は、代わりにwriteRDSまたはfst::write_fstを使用してください。

Answer 2

あなたはR.utilsでのgzip機能を使用することができます。

library(R.utils) 
    library(data.table) 

    #Write gzip file 
    df <- data.table(var1='Compress me',var2=', please!') 
    fwrite(df,'filename.csv',sep=',') 
    gzip('filename.csv',destname='filename.csv.gz')` 

    #Read gzip file 
    fread('gzip -dc filename.csv.gz') 
       var1  var2 
    1: Compress me , please!