私は主成分分析(PCA)を行っているデータセットを持っています。データを変換しようとすると、ValueError
というメッセージが表示されます。以下のコードの一部です:pandasデータフレームfillna()が機能していませんか?
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib as mpl
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.decomposition import PCA as sklearnPCA
data = pd.read_csv('test.csv',header=0)
X = data.ix[:,0:1000].values # values of 1000 predictor variables
Y = data.ix[:,1000].values # values of binary outcome variable
sklearn_pca = sklearnPCA(n_components=2)
X_std = StandardScaler().fit_transform(X)
それは私が次のエラーメッセージを取得することをここにある:
ValueError: Input contains NaN, infinity or a value too large for dtype('float64').
だから私は、元のデータセットは、任意のNaN値を持っていたかどうかをチェック:
print(data.isnull().values.any()) # prints True
data.fillna(0) # replace NaN values with 0
print(data.isnull().values.any()) # prints True
data.isnull().values.any()
は、NaN値を0に置き換えた後でも、まだTrue
と表示されています。