cicでdicomピクセルを読み取る方法

Question

いくつかのピクセル処理を行うためにDICOMファイルを解析する必要があります。私はDCMTKライブラリを試みましたが、それは私のために働いていません。 DICOMファイルを読みたいので、C++の軽量クロスプラットフォームライブラリのように、非常にシンプルなものがほしいです。

ご意見をいただければ幸いです。

Answer 1

ImageMagickを使用してDICOMファイルを読み取ることができます.DICOMファイルはフリーでクロスプラットフォームで、一般にLinuxディストリビューションにインストールされ、OSXおよびWindowsで使用できます。あなたはバージョン7.xを使用したい場合はバージョン6.xのサンプルは以下の

...

//////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// 
// sample.cpp 
// Mark Setchell 
// 
// ImageMagick Magick++ sample code 
// 
// Compile with: 
// g++ sample.cpp -o sample $(Magick++-config --cppflags --cxxflags --ldflags --libs) 
//////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// 
#include <Magick++.h> 
#include <iostream> 

using namespace std; 
using namespace Magick; 

int main(int argc,char **argv) 
{ 
    // Initialise ImageMagick library 
    InitializeMagick(*argv); 

    // Create Image object and read in DICOM image 
    Image image("sample.dcm"); 

    // Get dimensions 
    int w = image.columns(); 
    int h = image.rows(); 
    cout << "Dimensions: " << w << "x" << h << endl; 

    PixelPacket *pixels = image.getPixels(0, 0, w, h); 

    for(int y=0; y<h; y++){ 
     for(int x=0; x<w; x++){ 
     Color color = pixels[w * y + x]; 
     cout << x << "," << y << ":" << color.redQuantum() << "/" << color.greenQuantum() << "/" << color.blueQuantum() << endl; 
     } 
    } 
} 

サンプル出力は

Dimensions: 512x512 
0,0:0/0/0 
1,0:0/0/0 
2,0:0/0/0 
3,0:0/0/0 
4,0:0/0/0 
5,0:0/0/0 
6,0:0/0/0 
7,0:0/0/0 
8,0:0/0/0 
9,0:0/0/0 
10,0:0/0/0 
11,0:0/0/0 
12,0:0/0/0 
13,0:0/0/0 
14,0:0/0/0 
15,0:0/0/0 
16,0:0/0/0 
17,0:0/0/0 
18,0:0/0/0 
19,0:0/0/0 
20,0:0/0/0 
21,0:0/0/0 
22,0:0/0/0 
23,0:0/0/0 
24,0:0/0/0 
25,0:0/0/0 
... 
... 
260,18:80/80/80 
261,18:144/144/144 
262,18:192/192/192 
263,18:80/80/80 
264,18:32/32/32 
265,18:144/144/144 
... 
... 

、エリックの技術hereを参照してください。

または、ターミナルでコマンドラインで、次のような生の8ビットのRGBのバイナリデータにファイルを変換することができます

# Convert 512x512 image to 8-bit RGB binary file 
convert sample.dcm -depth 8 rgb:image.bin 

ls -l image.bin 
-rw-r--r-- 1 mark staff 786432 30 Jun 15:29 image.bin 

あなたがうまくいけば、画像が今786432であることをファイルサイズから見ることができますあなたが取得します知って512×512ピクセルのそれぞれについて、3バイトですので、あなたが直接あなたのCにデータを読み取ることができ++プログラムのバイト、：

RGB RGB RGB RGB ... RGB 

または、ターミナルでコマンドラインで、あなたがイメージをダンプすることができますデータは16進数として：

convert sample.dcm -depth 8 txt: | more 

サンプル出力

# ImageMagick pixel enumeration: 512,512,65535,gray 
0,0: (0,0,0) #000000 gray(0) 
1,0: (0,0,0) #000000 gray(0) 
2,0: (0,0,0) #000000 gray(0)