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に仕上げていません効果。私が使用しています式は次のとおりです。線形混合効果モデルは私がランダムとして親族行列を当てはめていますように私は、モデルを実行するためにパッケージ<a href="https://www.rdocumentation.org/packages/coxme/versions/2.2-5/topics/lmekin" rel="nofollow noreferrer">lmekin</a>を使用して線形混合効果モデルはR.</p> <p>に完了していないとの問題を抱えているR
モデル< - lmekin（病気〜スコア+年齢+（1 | IID）、データ= phenotype_df、 変数リスト= kinship_mx）
phenotype_dfは、データフレームであります疾患状態（1または0）、スコアおよび年齢をそれぞれ有する12000人の個体を有する。 （注：ここでは病気の状態を定量的に扱っています）。 kinship_mxは、親族マトリックスです。対角0.5以下の正定値行列（12000×12000）です。
このモデルは、約1000人を使用すると約1分で動作します。しかし、私は大規模なサーバー上に12000人の個人すべてと実行するモデルを残し、それは5日後に終了していません。誰にも、なぜこれが起こっているのか、そしてモデルを完成させるための解決策があるのかという理由を示唆することはできますか？
私の経験では全く意味がありません。 12000はサイズがばかげていないし、あなたがやることを求めているのは比較的単純です。システムプロファイラ/タスクマネージャをチェックして、実際に実行中かどうかを確認できます。次に、あなたのローカルマシン上で毎回1000を追加してスクリプトを実行し、ある時点でデバッグできるエラーメッセージが表示されるかどうかを確認します。 – sconfluentus
詳細情報を返信するだけです。私は 'top'をチェックしました。私は "1000を追加"しようとしています - 2000人で走るのに50分かかりました。他のインクリメントで実行しています。 – IcedCoffee
この場合、rからのマルチコアライブラリの1つを使用して回避策を広げてみてください。 – sconfluentus