私は私が持っているすべてのフレームで(少しの変更で)同じコマンドを実行するために、このコードを実行しようとしている:TypeError例外は:ないstrを、NULLバイトせずに文字列でなければなりません
traj.reset()
import os
#os.chdir(outname)
for i, frame in enumerate(traj):
frame.superpose()
comando = "python hollow.py -c constraint -o hollow_%s.pdb urei%s.pdb" % (i, i)
os.system(comando)
pml_cmd = "pymol urei%s.pdb hollow_%s.pdb -c -d 'as cartoon, urei%s;color gray90, urei%s;center chain A;set_view (\-0.605158150,0.089404292,0.791067421,\0.795849979,0.093013920,0.598304033,\-0.020089993,0.991641700,-0.127439827,\0.000000000,0.000000000,-202.017959595,\-28.771762848,-7.683309555,10.745590210,\-568.485290527,972.520690918,-20.000000000);bg white;as sphere, hollow_%s;color cyan, hollow_%s;ray;save urei%s.png' " % (i, i, i, i, i, i, i)
os.system(pml_cmd)
#remove = "rm urei%s.pdb hollow_%s.pdb" % (i, i)
#os.system(remove)
os.chdir("../")
私はこれを実行しますそして、私はこのエラーを取得:
TypeError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-8-53cd3e7bd107> in <module>()
7 os.system(comando)
8 pml_cmd = "pymol urei%s.pdb hollow_%s.pdb -c -d 'as cartoon, urei%s;color gray90, urei%s;center chain A;set_view (\-0.605158150,0.089404292,0.791067421,\0.795849979,0.093013920,0.598304033,\-0.020089993,0.991641700,-0.127439827,\0.000000000,0.000000000,-202.017959595,\-28.771762848,-7.683309555,10.745590210,\-568.485290527,972.520690918,-20.000000000);bg white;as sphere, hollow_%s;color cyan, hollow_%s;ray;save urei%s.png' " % (i, i, i, i, i, i, i)
----> 9 os.system(pml_cmd)
10 #remove = "rm urei%s.pdb hollow_%s.pdb" % (i, i)
11 #os.system(remove)
TypeError: must be string without null bytes, not str
私はインターネットで検索が、私は良い答えを見つけることができません。
pml_cmd = R "PYMOLのUREI%sの: