Python Matplotlib：PatchCollectionアニメーションが更新されない

Question

matplotlibアニメーションを最適化しようとしていますが、繰り返しごとにプロットに矩形を追加します。アニメーション機能は反復ごとにパッチのセット全体を更新するので、大きなセットのパッチでは非常に遅いです。

いくつかの情報源によれば、パッチをループする代わりにPatchCollectionを使用することで、このプロセスを高速化できます。これは私の試みです：

from matplotlib import pyplot 
from matplotlib import patches 
from matplotlib import animation 
from matplotlib.collections import PatchCollection 

fig = pyplot.figure() 

coords = [[1,0],[0,1],[0,0]] #arbitrary set of coordinates 

ax = pyplot.axes(xlim=(0, len(coords)), ylim=(0, len(coords))) 
ax.set_aspect('equal') 


patchList = list() 

for coord in coords: 
    patch = patches.Rectangle(coord, 1, 1, color="white") 
    ax.add_patch(patch) 
    patch.set_visible = True 
    patchList.append(patch) 

rectangles = PatchCollection(patchList, animated=True) 
ax.add_collection(rectangles) 


black = [] 
white = ["white"]*len(patchList) 

def animate(i): 
    black.append("black") 
    white.pop() 

    colors = black + white 
    print(colors) 

    rectangles.set_facecolors(colors) 
    print("%.2f%%..."%(100*float(i+1)/len(coords))) 

    return rectangles, 

anim = animation.FuncAnimation(fig, animate, 
           # init_func=init, 
           frames=len(coords)-1, 
           interval=1, 
           blit=True, 
           repeat = False) 

pyplot.show() 

アニメーションは決して更新されません。それは空のプロット上で凍結されます。

私はこれを他の方法で最適化することができます。現在のソリューションは、各フレームを1つの長方形に追加するだけで非常に冗長に見えます。

Answer 1

私はあなたのコードを完全に理解していません。矩形のfacecolorを白から黒に切り替えることは、その矩形をプロットに「追加する」という考えですか？

あなたのコードがうまくいかなかった理由を理解するのに少し時間がかかりましたが、それは愚かな間違いであることが判明しました。問題はラインax.add_patch(patch)です。実際には、1つのRectangleインスタンスとして1回、PatchCollectionの一部として2つ目の四角形をプロットに追加しています。 Rectanglesがコレクションの上にとどまっているように見えるので、アニメーションが表示されないだけです。違反行（ax.add_patch(patch)）にコメントするだけで、問題が解決されたようです。

また、FuncAnimation(..., interval=)はアニメーションを見ることがmsで表現されるので、あなたは、より大きな何かに値を増やすことができます（1S 100ミリ秒、または1000ミリ秒すなわち）。

ここで私はコード（loosely inspired by this question on SOを）書くでしょうか：

Nx = 30 
Ny = 20 
size = 0.5 

colors = ['w']*Nx*Ny 

fig, ax = plt.subplots() 

rects = [] 
for i in range(Nx): 
    for j in range(Ny): 
     rect = plt.Rectangle([i - size/2, j - size/2], size, size) 
     rects.append(rect) 

collection = PatchCollection(rects, animated=True) 

ax.add_collection(collection) 
ax.autoscale_view(True) 

def init(): 
    # sets all the patches in the collection to white 
    collection.set_facecolor(colors) 
    return collection, 

def animate(i): 
    colors[i] = 'k' 
    collection.set_facecolors(colors) 
    return collection, 

ani = FuncAnimation(fig, init_func=init, func=animate, frames=Nx*Ny, 
     interval=1e2, blit=True)