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私は与えられたKEGG化合物のInChI表現を検索したいと思いますが、私はこれに直接的な解決策を見つけることができません。KEGG化合物のInChIキーの取得方法は?
一つは、このようChEBI経由でそれを行うことができます:
NCCCC[[email protected]](N)C(O)=O
InChI=1S/C6H14N2O2/c7-4-2-1-3-5(8)6(9)10/h5H,1-4,7-8H2,(H,9,10)/t5-/m0/s1
KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N
を出力します
from bioservices import *
kegg_con = KEGG()
kegg_entry = kegg_con.parse(kegg_con.get('C00047'))
chebi_con = ChEBI()
chebi_entry = chebi_con.getCompleteEntity('CHEBI:' + kegg_entry['DBLINKS']['ChEBI'])
print chebi_entry.smiles
print chebi_entry.inchi
print chebi_entry.inchiKey
はChEBI
を経由して行くことを必要としない直接的な方法はありますか?
ありがとうございます。はい、私は別の目的のためにchemspiderを使用します([この質問/回答](https://stackoverflow.com/questions/45996962/how-to-interconvert-inchi-and-inchikey)参照))。それはうまくいくかも... – Cleb