システムポーズ/スリープを使用して徐々にプロットします

Question

次のコードがありますが、期待通りに機能しません。

for(i in 3:nrow(pima_diabetes_kmean)){ 
    k.means.fit <- kmeans(pima_diabetes_kmean[1:i, c("Pregnancy", "Age")], 2) 
    plot(
    pima_diabetes_kmean[1:i, c("Pregnancy", "Age")], 
    col = alpha(k.means.fit$cluster, 0.2), 
    pch = 20, 
    cex = 3, main = "Clusters predicted by models" 
) 
    points(
    k.means.fit$centers, 
    pch = 4, 
    cex = 4, 
    lwd = 4, 
    col = "blue" 
) 
    Sys.sleep(0.001) 
} 

ループを削除して一度にプロットすることができます。しかし、代わりに最初の3行のデータをプロットしてから、0.001sのギャップのあと4行をプロットし、次に5などをプロットしたいと思います。最終的にすべてのデータ点をプロットします。

私は、各ポイントの追加がクラスタ化にどのように影響するかを示すビデオまたはgifを作成できるように、プロセスをキャプチャします。しかし、このプロットはforループが存在しないかのように、段階的にではなく、一度にすべてをプロットしています。

Answer 1

これは、それが働いた方法です：

png(file="kMeanPlot%03d.png", width=719, height=539) 
for(i in seq(3, nrow(pima_diabetes_kmean), by = 20)){ 
    k.means.fit <- kmeans(pima_diabetes_kmean[1:i, c("Pregnancy", "Age")], 2) 
    plot(
    pima_diabetes_kmean[1:i, c("Pregnancy", "Age")], 
    col = alpha(k.means.fit$cluster, 0.2), 
    pch = 20, 
    cex = 3, main = "Clusters predicted by models" 
) 
    points(
    k.means.fit$centers, 
    pch = 4, 
    cex = 4, 
    lwd = 4, 
    col = "blue" 
) 
} 
dev.off() 

# convert the .png files to one .gif file using ImageMagick. 
# The system()/shell() function executes the command as if it was done 
# in the terminal. the -delay flag sets the time between showing 
# the frames, i.e. the speed of the animation. 
# You will need to install the imagemagick for this 
# Following command for non-windows OS 
# system("C:/Program Files/ImageMagick-7.0.5-Q16/convert -delay 80 *.png fucked.gif") 
# Following command for Windows OS 
shell("convert -delay 40 *.png kMeanPlot.gif") 

# to not leave the directory with the single png files I remove them. 
file.remove(list.files(pattern="[kMeanPlot]*.png"))