RStudioを使用してワークスペースからまっすぐにknitrマークダウンする方法はありますか？

Question

knitr markdownを使用して、現在のワークスペースに由来するオブジェクトを使ってオンザフライでレポートを作成できるかどうかは疑問です。再現性はここでは問題になりません。私もこの非常に細かいthread hereを読んでいます。

でも、特定のオブジェクトが見つからないというエラーメッセージが表示されます。

1）新しいマークダウン文書を開いて保存するとします。

2）lmオブジェクトを参照するチャンクを自分のワークスペースに書き込みます。コールsummary(mylmobject)

3）ニットそれです。

レポートは生成されますが、オブジェクトが見つからないために回帰出力が表示されません。注意してください。一般的には、オブジェクトを.Rdataに保存してから、マークダウンファイルから直接ロードするだけです。

現在の作業領域にあるオブジェクトをRマークダウンで使用する方法はありますか？ これはまだ働いている間に非R人に何らかの出力を見せてくれるのが本当にいいですね。 （これら2つの別々のセッションです）

Answer 1

RStudioは、あなたのRマークダウンファイルをknit()する新しい Rセッションを開きますので、あなたの現在の作業スペース内のオブジェクトは、そのセッションに使用することはできません。二つの解決策：

1. ファイルRStudioにfeature request、代わりに強制的に新しいセッションを開始する現在のRセッションで編み物をサポートするためにそれらを尋ねます。
2. は自分で手動ニット：library(knitr); knit('your_file.Rmd')使用して、他のセッションからあなたのデータを保存する方が簡単かもしれません

Answer 2

（またはknit2html()をおR Markdown v2を使用している場合、あなたが一歩、またはrmarkdown::render()でHTML出力をしたい場合）：

その後、

save.image("C:/Users/Desktop/example_candelete.RData") 

とあなたのMDファイルにロード：

load("C:/Users/Desktop/example_candelete.RData") 

Answer 3

Markdownreports packageは、オンザフライでマークダウン文書を解析するために設計されています。