Building R RcppArmadillo、RcppEigenを使用し、Cpp11プラグインに依存するパッケージ

Question

このウェブサイトまたはDirk、Hadleyまたは他の人が公表した注意事項に関するこれまでの説明に従いました。しかし、私はまだcpp11プラグインに関する問題のために私のパッケージを構築する際に問題があります。

RcppArmadillo.package.skeleton()機能を使用しました。私は自分のcppファイルをsrcディレクトリに置いています。 NAMESPACEファイルは、importFrom(Rcpp, sourceCpp)行を含むはずです。私もDESCRIPTIONファイルを編集しました。LinkingToセクションでは、RcppEigenと私が使用する他のパッケージを追加しました。私は最終的にRでcompileAttributes(verbose=TRUE)関数を実行し、すべてが正常に見えました。それゆえ、私は、私が必要なすべてをやったと思う。私はまた、sourceCpp()を使用してRでコードをコンパイルすると、完璧に動作し、エラーなしでコンパイルされることにも言及する必要があります。 より良い私の依存関係が何であるかを説明するために、私はここに私のコードの最初のブロックを置く：

#include <RcppArmadillo.h> 
    #include <RcppNumerical.h> 
    #include <RcppArmadilloExtensions/sample.h> 
    #include <Eigen/LU> 
    #include <algorithm> 

    // [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]] 
    // [[Rcpp::depends(RcppEigen)]] 
    // [[Rcpp::depends(RcppNumerical)]] 
    // [[Rcpp::plugins(cpp11)]] 

問題がある、私は私のパッケージを構築し、私はラインのためのエラーと警告を得るとき、私はに関しautoタイプを持っていますcpp11プラグイン。

このウェブサイト上で同様の記事を検索した後、私は++、11 Cを使用するために私のRコンパイラを強制しなければならないと結論付けたと私は私のMakvarsファイルが~/.R/Makevarsに位置し、私はMACを使用するので、私は、この行を追加したが、編集FOREそのファイルに CXX=clang++ -std=c++11。しかし、私がそうすると、3つのエラーは消えてしまいますが、mat、uvecなどのすべてのArmadillo変数タイプは認識されなくなるため、50の新しいエラーが生成されます。だから私はこれを修正する方法を知らない。

基本的には// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]を入れてください.Rcppの新しいバージョンがこのプラグインをサポートしているので、おそらくその理由は私がsourceCppをRで実行したときにエラーがなく、すべて正常です。しかし、パッケージを作るときに何が起こるのか分かりません。私のRcppのバージョンは0.12.8です。 ご協力いただきありがとうございます。

Answer 1

依存関係（つまり、他のヘッダー）とコンパイラオプションの両方のプラグインは、sourceCpp()によって使用されます。

パッケージは、C++ 11ディレクティブ、src/MakevarsまたはSystemRequirementsのいずれかのために、LinkingTo:でこれを行うと。これについては、Writing R Extensionsを参照してください。