geepack
パッケージを使用して回帰をいくつか行い、欠損値を処理するために複数の代用を使用したいとします。私はgeepack
のデータを使用できるように、mi
のpool()
コマンドは私のGEEでは機能しません。 complete()
関数は、各反復を生成しますが、プールされた推定は生成されません。 プールされた推定値を持つデータフレームを生成する方法はありますか?「mi」パッケージからのプールされたGEE推定値のエクスポート
1
A
答えて
0
miパッケージ内のcomplete
関数は、m
data.framesのリストを生成します。そのリストの各要素にdata
引数のgee
を呼び出し、Rubinの規則を使用してプールされた見積もりを取得することができます。
0
RでRubinのルールを実装するパッケージ(たとえば、mi
、mice
、mitools
、およびmitml
)がある場合は、いくつかあります。問題は、これらの実装では、統計モデルをフィッティングする関数にcoef()
とvcov()
の作業方法が定義されている必要があることです。
しかし、geeglm()
関数はvcov()
を定義しておらず、標準実装は機能しません。その状況を改善するには、欠落しているメソッドをGEEに定義するのが最も簡単です。以下は、mitml
パッケージと、geepack
で提供されるサンプルデータセットの1つを使用する例です。
library(geepack)
library(mitml)
# example data
data(dietox)
# example imputation
fml <- Feed + Weight ~ 1 + Time + (1|Pig)
imp <- panImpute(data=dietox, formula=fml, n.burn=5000, n.iter=500)
implist <- mitmlComplete(imp, "all")
# fit GEE
fit <- with(implist, geeglm(Weight ~ 1 + Time + Feed, id=Pig))
# define missing vcov() function for geeglm-objects
vcov.geeglm <- function(x) summary(x)$cov.scaled
# combine estimates using Rubin's rules
testEstimates(fit)
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