半透明のエッジ（igraph、R）による予期しない矢印の色の動き

Question

Rのigraphパッケージを使用して、次の予期しない動作が発生しました。グラフのedge.arrow.modeが3（または両端の矢印が"<->"）と指定されていて、edge.colorがのrgb()と指定されている場合、矢印はとなります色はです。一方の端に2つの矢印があるように見え、重なっていると暗い色になります。

これは、グラフがいくつかの矢印を他のものよりも暗く（より重要に見える）ようにするため、望ましくありません。私が可視化しようとしている実際のグラフは無向です。（すべての灰色、半透明の）辺の端にある矢印は、特定の頂点にいくつの接続があるかを示すために使用されます（グラフはかなり大きい頂点に重なるエッジがあるため、エッジが頂点に接続する場所を視覚的に判断することは容易ではありません（半透明のエッジや頂点を使用する理由もあります）。

ここではいくつかの作業例を示します。

library("igraph") 
plot(make_tree(5, mode="undirected"), vertex.size=10, edge.arrow.mode=3, edge.color=rgb(0,0,0,0.2)) 
plot(make_tree(5, mode="undirected"), vertex.size=10, edge.arrow.mode=3, edge.color=rainbow(5, alpha=0.3)) 

質問は、これを回避する方法は、はとても矢印はすべて同じになりますがありますか？

頂点の接続の数を視覚的に他の方法で表示することもできます（ただし、頂点の色（フルカラーのスペクトル）は既に別の視覚補助用に使用されていることに注意してください）。その上に頂点の彩色を施すと、虹のようなものになります）。接続の度合いを示すために頂点の形状を変更することは良い解決策ではありません（編集 - Tadのおかげで）。すべての矢頭を単色にすることも可能です（ただし、エッジカラーとは別に矢印色を変更する方法はありません）。

（ボーナス：これはバグやIGRAPHの特徴である？）

Answer 1

あなたは単にノード次数に基づいて頂点のサイズを変更できますか？

grph <- make_tree(5, mode="undirected") 
plot(grph, vertex.size=degree(grph)*5, edge.arrow.mode=0, 
    edge.color='black') 

これは加重ネットワーク内のノードの強度のアイデアを与えることができる縁（edge.width）の厚さを変更することも可能です。これは実際には適用されません。

編集： 透明度の高いノードの度合いが小さくなるように、色のアルファチャンネルを変更するとどうなりますか？それ以外は、私は迷っています。無向グラフ上に矢印を置くことは、一般的には悪いアイデアのように思えます。特にノードの度合いを視覚化する手段である場合にはそうです。

colShift <- function(x, alpha){ 
         x <- col2rgb(x)/255 
         rgb(x[1], x[2], x[3], alpha=alpha) 
        } 

grph <- make_tree(5, mode="undirected") %>% 
     set_vertex_attr('color', value='dodgerblue4') 

vertAlpha <- 1.1 - 1/degree(grph) 
vertColor <- colShift(vertex_attr(grph, 'color'), vertAlpha) 

V(grph)$color <- vertColor 

plot(grph, vertex.size=degree(grph)*5, edge.arrow.mode=0, 
    edge.color='black')