私はminiconda2(python2.7インストール)を実行しています。 miniconda3を並べて使用するのではなく、python3.5環境を作成してみました。しかし、numpyをインポートしようとすると、pythonがpython2.7に対してnumpyをロードしようとするため、エラーが発生します。これは、.bashrc
に設定されている環境変数がminiconda2に設定されているためです。Conda env正しいバージョンのnumpyをロードしていません
これを修正するにはどうすればよいですか?私はconda python2とpython3を並べて使うことができる方法はありますか?
マイ.bashrc
があります
export PYTHONLIB="/home/exacloud/lustre1/CompBio/miniconda2/lib"
export PYTHONPATH="/home/exacloud/lustre1/CompBio/miniconda2/lib/python2.7/site-packages"
export PYTHONUSERBASE="/home/exacloud/lustre1/CompBio/miniconda2"
export CONDA_BIN="/home/exacloud/lustre1/CompBio/miniconda2/bin"
セッション:
[email protected]:~$ conda create -n p3 python=3 pandas numpy
Fetching package metadata .............
Solving package specifications: ..........
Package plan for installation in environment /<path>/miniconda2/envs/p3:
The following NEW packages will be INSTALLED:
blas: 1.1-openblas conda-forge
ca-certificates: 2016.8.31-0 conda-forge
certifi: 2016.8.31-py35_0 conda-forge
libgfortran: 3.0.0-1
ncurses: 5.9-9 conda-forge
numpy: 1.11.2-py35_blas_openblas_200 conda-forge [blas_openblas]
openblas: 0.2.18-5 conda-forge
openssl: 1.0.2h-2 conda-forge
pandas: 0.19.0-np111py35_0 conda-forge
pip: 8.1.2-py35_0 conda-forge
python: 3.5.2-2 conda-forge
python-dateutil: 2.5.3-py35_0 conda-forge
pytz: 2016.7-py35_0 conda-forge
readline: 6.2-0 conda-forge
setuptools: 26.1.1-py35_0 conda-forge
six: 1.10.0-py35_1 conda-forge
sqlite: 3.13.0-1 conda-forge
tk: 8.5.19-0 conda-forge
wheel: 0.29.0-py35_0 conda-forge
xz: 5.2.2-0 conda-forge
zlib: 1.2.8-3 conda-forge
Proceed ([y]/n)? y
Linking packages ...
[ ]| [ca-certificates ]| [libgfortran ]|#### [ncurses ]|######## [sqlite ]|############# [tk ]|################# [openblas ]|####################### | 33%
Screen session on s (system load: 1.12 1.05 0.91) Thu 27.10.2016 14:43
wheel: 0.29.0-py35_0 conda-forge
xz: 5.2.2-0 conda-forge
zlib: 1.2.8-3 conda-forge
Proceed ([y]/n)? y
Linking packages ...
[ ]| [ca-certificates ]| [libgfortran ]|#### [ncurses ]|######## [sqlite ]|############# [tk ]|################# [openb[ COMPLETE ]|######################################################################| 100%
No psutil available.
To proceed, please conda install psutil#
# To activate this environment, use:
# $ source activate p3
#
# To deactivate this environment, use:
# $ source deactivate
#
[email protected]:~$
[email protected]:~$ source activate p3
(p3) [email protected]:~$ python
Python 3.5.2 | packaged by conda-forge | (default, Jul 26 2016, 01:32:08)
[GCC 4.8.2 20140120 (Red Hat 4.8.2-15)] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import numpy as np
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/<path>/miniconda2/lib/python2.7/site-packages/numpy/__init__.py", line 142, in <module>
from . import add_newdocs
File "/<path>/miniconda2/lib/python2.7/site-packages/numpy/add_newdocs.py", line 13, in <module>
from numpy.lib import add_newdoc
File "/<path>/miniconda2/lib/python2.7/site-packages/numpy/lib/__init__.py", line 8, in <module>
from .type_check import *
File "/<path>/miniconda2/lib/python2.7/site-packages/numpy/lib/type_check.py", line 11, in <module>
import numpy.core.numeric as _nx
File "/<path>/miniconda2/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/__init__.py", line 14, in <module>
from . import multiarray
ImportError: dynamic module does not define module export function (PyInit_multiarray)
>>>
condaで述べたように、あなたのvirtualenvにpsutilsをインストールしましたか? –
@ P.Camilleriあなたはそれを私に指摘できますか?私はpsutilsについて、私が従っている文書(http://conda.pydata.org/docs/using/envs.html)には何も見ません。しかし、恐らく私は 'conda create -n p3 python = 3 anaconda'を試してみるべきです。 numpyの適切なバージョンがリンクされていることを保証しますか? – abalter
Weelには、あなたが含まれているコードに、psutilを利用できないという行があります。続行するには、psutilをインストールしてください。しかし、それはあなたの問題を修正したようです! –