2017-12-07 28 views
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私はデータフレームmydfを以下のように持っています。私はA、C、G、Tの列が棒グラフ(サンプルプロットの年)で表される積み重ねられた3次元プロット(下のサンプルプロットに示すように)をプロットしたいと思います。それぞれのfile.nameの長さの列の範囲は18から34で、例のプロットのようにGas Type軸上にあるようにしたい場合は、最後にfile.nameの列をcountry axisのように下のサンプルプロットにします。これをRでプロットするにはどうすればよいですか?ご協力いただきありがとうございます。3d積み重なった棒グラフをR

Sample plot

mydf <- structure(list(file.name = structure(c(1L, 1L, 2L, 2L, 4L, 4L 
    ), .Label = c("merged_read_counts", "DCL1_VF_1_GAGTGG_L008_R1_001", 
    "DCL1_VF_2_GGTAGC_L008_R1_001", "DCL2_VF_1_ACTGAT_L008_R1_001", 
    "DCL2_VF_2_ATGAGC_L008_R1_001", "DCLd_SSHADV1_1_AGTTCC_L008_R1_001", 
    "DCLd_SSHADV1_2_ATGTCA_L008_R1_001", "DCLd_SSHADV1_3_CCGTCC_L008_R1_001", 
    "DCLd_SSHV2L_1_GTAGAG_L008_R1_001", "DCLd_SSHV2L_2_GTCCGC_L008_R1_001", 
    "DCLd_SSHV2L_3_GTGAAA_L008_R1_001", "DCLd_VF_1_GTGGCC_L008_R1_001", 
    "DCLd_VF_2_GTTTCG_L008_R1_001", "DCLd_VF_3_CGTACG_L008_R1_001", 
    "WT_SSHADV1_1_GGCTAC_L008_R1_001", "WT_SSHADV1_2_CTTGTA_L008_R1_001", 
    "WT_SSHADV1_3_AGTCAA_L008_R1_001", "WT_SSHV2L_1_GCCAAT_L008_R1_001", 
    "WT_SSHV2L_2_CAGATC_L008_R1_001", "WT_SSHV2L_3_ACTTGA_L008_R1_001", 
    "WT_SSHV2L_4_GATCAG_L008_R1_001", "WT_SSHV2L_5_TAGCTT_L008_R1_001", 
    "WT_VF_1_ATCACG_L008_R1_001", "WT_VF_2_CGATGT_L008_R1_001", "WT_VF_3_TTAGGC_L008_R1_001", 
    "WT_VF_4_TGACCA_L008_R1_001", "WT_VF_5_ACAGTG_L008_R1_001"), class = "factor"), 
     length = c(18L, 19L, 18L, 19L, 18L, 19L), A = c(2294436L, 
     2588528L, 52104L, 47190L, 103378L, 59269L), C = c(1501040L, 
     2838174L, 35888L, 93922L, 38132L, 31912L), G = c(2106623L, 
     1714702L, 80765L, 64930L, 129040L, 161517L), T = c(5065628L, 
     7462881L, 62174L, 87905L, 274783L, 110125L)), .Names = c("file.name", 
    "length", "A", "C", "G", "T"), row.names = c(1L, 2L, 18L, 19L, 
    58L, 59L), class = "data.frame") 
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[スティーブン少数の分析]を参照してください(http://www.perceptualedge.com/example3.php):ような何か。 – Uwe

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[ggplot2 3Dバープロット]の可能な複製(https://stackoverflow.com/questions/26794236/ggplot2-3d-bar-plot) –

答えて

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私は三次元のバープロットはggplot(ggplot2 3D Bar Plot)で提供されていないと思います。

代わりに、グループ化された積み重ねられたバープロットをお勧めします。 3D棒グラフの設計上の問題と、彼が示唆された選択肢の

library(ggplot2) 
library(reshape2) 
df <- melt(mydf,id.vars=c("file.name","length")) 
ggplot(df, aes(x = file.name, y = value, fill = variable)) + 
    geom_bar(stat = 'identity', position = 'stack') + facet_grid(~ length) 
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ありがとうございますが、このプロットは私の大きなデータで本当にうんざりしています。 – MAPK

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