許可

Question

[パイソン、Jupyter、Ubuntuの16]

私はbokehをインストールしたpython3.5のvirtualenvのを持っています。私は、インポートするとうまくグラフを定義することができます。

p.xaxis.axis_label = 'petal len' 
p.yaxis.axis_label = 'petal width' 
p.circle(flowers['petal_length'], flowers['petal_width'], color=colors, fill_alpha=0.2, size=10) 

が、私はshow(p)を呼び出すときに、私は以下のようになります。

PermissionError       Traceback (most recent call last) 
<ipython-input-7-52ee71fc1db5> in <module>() 
     2 p.yaxis.axis_label = 'petal width' 
     3 p.circle(flowers['petal_length'], flowers['petal_width'], color=colors, fill_alpha=0.2, size=10) 
----> 4 show(p) 

/home/USERNAME/ve/ml/lib/python3.5/site-packages/bokeh/io.py in show(obj, browser, new, notebook_handle) 
    298  if obj not in _state.document.roots: 
    299   _state.document.add_root(obj) 
--> 300  return _show_with_state(obj, _state, browser, new, notebook_handle=notebook_handle) 
    301 
    302 

/home/USERNAME/ve/ml/lib/python3.5/site-packages/bokeh/io.py in _show_with_state(obj, state, browser, new, notebook_handle) 
    316 
    317  if state.file or not shown: 
--> 318   _show_file_with_state(obj, state, new, controller) 
    319 
    320  return comms_handle 

/home/USERNAME/ve/ml/lib/python3.5/site-packages/bokeh/io.py in _show_file_with_state(obj, state, new, controller) 
    321 
    322 def _show_file_with_state(obj, state, new, controller): 
--> 323  filename = save(obj, state=state) 
    324  controller.open("file://" + filename, new=_new_param[new]) 
    325 

/home/USERNAME/ve/ml/lib/python3.5/site-packages/bokeh/io.py in save(obj, filename, resources, title, state, validate) 
    380 
    381  filename, resources, title = _get_save_args(state, filename, resources, title) 
--> 382  _save_helper(obj, filename, resources, title, validate) 
    383  return os.path.abspath(filename) 
    384 

/home/USERNAME/ve/ml/lib/python3.5/site-packages/bokeh/io.py in _save_helper(obj, filename, resources, title, validate) 
    447   html = standalone_html_page_for_models(obj, resources, title) 
    448 
--> 449   with io.open(filename, "w", encoding="utf-8") as f: 
    450    f.write(decode_utf8(html)) 
    451 

PermissionError: [Errno 13] Permission denied: '/usr/lib/python3.5/runpy.html' 

私は無駄にchown -R 755 /usr/lib/python3.5を試してみました。 ~/virtualenv/lib/python3.5は（奇妙なことに）ほとんど777ですが、これは新しくインストールしたときのように、私はそれが意図的だと思います。

Answer 1

いつ出力を表示するかを明示的に指定するには、output_fileまたはoutput_notebookを使用することをお勧めします。 Jupyterノートブックのインラインプロットの場合、output_notebookは実際にはが必要です。これは、必要なBokehJSライブラリをノートブックにロードするコマンドであるためです。これらのいずれかを指定しなければ、BokehはHTMLファイルに保存して表示しようとします。 0.12.5より前Bokehは現在のモジュール名を使用して場所を推測しようとしますが、これは上の問題を引き起こす場合があります。 0.12.5の後Bokehは書き込み可能であることが保証されているOS提供の一時ファイルの場所を使用します。