Biopythonスクリプトが動作していない、errortypeジェネレータを送信します

Question

私はbiopythonでXMLファイルを解析しようとしているときに理解できません。

TypeError: object of type 'generator' has no len() 

    from Bio import SearchIO 
    blast_qresults=SearchIO.parse('my_file.xml', 'blast-xml') 
    len(blast_qresults) 

    or 

    blast_qresults.hit 

AttributeError: 'generator' object has no attribute 'hit 

Answer 1

私は、これはあなたがしたい構文であると信じて：

from Bio import SearchIO 

blast_qresults = SearchIO.parse('my_file.xml', 'blast-xml') 

for hit in blast_qresults: 
    print(hit) 

blast_qresultsが発電機であるので、あなたは一度だけ、それを「歩く」ことができます。