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あなたが言及したように、VMFSは、「ブロック」共有ストレージ(つまりLUN)を上の私たちは、デフォルトで使用するファイルシステムです。これにより、多数のファイルシステムでは許可されていない複数のESXiホストで同じLUNを読み取り/書き込み用にマウントすることができます。
vMotionは実行中のVMをあるESXiホストから別のESXiホストに移動するときです。これは、実行中のメモリ状態をあるホストから別のホストにコピーすることで行います。その後、短時間の間、VMを「停止」し、その仮想NICを新しいサーバーにすばやく移動します。 VMは、同じ状態で遠い側で「開始」します。したがって、VMは常に実行されていたように見えます。すなわち、実際にはまったく同じメモリ状態とディスクを持つ新しいVMを作成しているにもかかわらず、実行中のVMを "移動"します。
唯一の関係は、VMDKが複数のESXiホスト間で共有されているDatastoreに存在するVMを持つ場合、vMotionプロセスはVMDKをコピーする必要がなくなるため、処理がはるかに簡単になります。 VMFSは共有ストレージをサポートする方法の1つで、VMFSベースのデータストア(この場合は1つのデータストア= 1つのVMFSフォーマットLUN)にVMDKを配置するのが一般的です。 VMFSは当社の最古の共有ストレージ技術であるため、最も一般的であり、通常、お客様が最もよく理解することができます。
しかし、共有ストレージは、VSAN、VVOL、NFSベースの共有ストレージなど、vMotionで正常に動作します。
これは[Server Fault](http://serverfault.com)の方がより良い質問です。 – tadman