NetworkxとGraphvizの特定のノードの色付け

Question

私は距離行列からグラフをプロットするプログラムを書いています。それは正常に動作しています。 今、私は特定のノードと特定のエッジが私の選択の特定の色になるようにします。それ、どうやったら出来るの？

プログラムはPythonであり、あなたはGraphvizのが理解属性を使用する必要が描画を行うためにGraphvizのを使用しているのでNetworkxとGraphvizの

import networkx as nx 
import numpy as np 
import pickle 
from random import randint 

p_file = open('pickles/distance') 
Dist = pickle.load(p_file) 
p_file.close() 
p_file = open('pickles/names') 
Names = pickle.load(p_file) 
p_file.close() 

dt = [('len', float)] 
A = np.array(Dist)*5 
A = A.view(dt) 

G = nx.from_numpy_matrix(A) 
G = nx.relabel_nodes(G, dict(zip(range(len(G.nodes())),Names)))  

G = nx.to_agraph(G) 
G.node_attr.update(ndcolor="red", node="DC", style="filled") 
G.edge_attr.update(color="none") 
G.draw('P1.png', format='png', prog='neato') 

Answer 1

を使用しています。あなたは私のコードでは、私は距離行列からノードやエッジを追加してい見ることができるように参照してください

import networkx as nx 
G = nx.Graph() 

G.add_node(1,color='red',style='filled',fillcolor='blue',shape='square') 
G.add_node(2,color='blue',style='filled') 
G.add_edge(1,2,color='green') 
G.node[2]['shape']='circle' 
G.node[2]['fillcolor']='red' 

A = nx.to_agraph(G) 
A.layout() 
A.draw('color.png') 
print A.to_string() 

http://www.graphviz.org/content/attrsは

strict graph { 
    graph [bb="0,0,107.21,46.639"]; 
    node [label="\N"]; 
    1 [color=red, 
     fillcolor=blue, 
     height=0.5, 
     pos="18,28.639", 
     shape=square, 
     style=filled, 
     width=0.5]; 
    2 [color=blue, 
     fillcolor=red, 
     height=0.5, 
     pos="89.21,18", 
     shape=circle, 
     style=filled, 
     width=0.5]; 
    1 -- 2 [color=green, 
     pos="36.338,25.899 47.053,24.298 60.519,22.286 71.18,20.694"]; 
}