以下の行列（mydf）に5つのサンプルがあります。中心からサンプルまでのユークリッド距離は、Distance列で与えられます。どのようにして、中心と交差するサンプル（例えば、A：A、A：B、A：C .... E：E）の距離の対の組み合わせの間に関係行列を形成することができるか。だから、AからA（A：A）までのユークリッド距離を計算し、次にAをB（A：B）に中心合わせするなどの方法で計算する必要があります。たとえば、AからAの中心までの距離は（0.03994220 + 0.03994220）、AからBは（0.03994220 + 0.03704120）などとなります。中心からサンプル点までのペアワイズ距離行列を作成する
mydf
samples Distance
A 0.03994220
B 0.03704120
C 0.03580851
D 0.04404073
E 0.04350807
これはあなたが後にしている何ですか？
df1 <- as.data.frame(outer(df$Distance,df$Distance, '+'))
df1
# V1 V2 V3 V4 V5
#1 0.07988440 0.07698340 0.07575071 0.08398293 0.08345027
#2 0.07698340 0.07408240 0.07284971 0.08108193 0.08054927
#3 0.07575071 0.07284971 0.07161702 0.07984924 0.07931658
#4 0.08398293 0.08108193 0.07984924 0.08808146 0.08754880
#5 0.08345027 0.08054927 0.07931658 0.08754880 0.08701614
'rownames'と' colnames'を見てください – Sotos
申し訳ありません、これは私が持っているデータフレームでは機能しません： 'df <-structure（list（V1 = = Cの（ "860"、 "861"、 "862"、 "2529"、 "2530"）、.LABEL = C（ "0.0321300642107672"、 "0.0330817724920314"、 "0.0339978194537914"、 "0.0413104564905709"、 「0.0415935059053326 "、class =" factor "））、.Names =" Distance "、row.names = c（" 860 "、 " 861 "、" 862 "、" 2529 "、" 2530 "）、class =" data .frame "）' – MAPK
これは最初に数値に変換されます – Sotos
@sotosペアワイズ行列を作成できませんでした。私はAからA、AからB、AからC、Eへの距離をE. – MAPK
に加える必要があるので、ペアワイズ距離の別のデータフレームが必要ですか？ – Sotos
@Sotosはい私はちょうどペアワイズ関係の別のデータフレームがほしい。 – MAPK