WGCNAでは常に特性データが必要ですか？

Question

私はRNA-seq分析を行い、WGCNAで解析する予定ですが、私は形質データを含むいくつかの論文を見てきましたが、大きなRNA-seqサンプリングがありますが形質データはほとんどありません。私はそれが有効かどうか、WGCNAを発現データだけで、形質データは含まないと思っていました。

おかげ

Answer 1

はい、WGCNAは間違い特性データを対応することなく使用することができます。実際に、（モジュールを可能な機能面に関連付けるために）特性データを使用することは、ネットワーク構築後に行われ、別個のステップである。

モジュールを特有のデータに関連付ける必要はありません。また、遺伝子セット濃縮分析などに基づいてモジュールを定義することもできます。