R警告：要因で間違い

Question

マイRコードは次のとおりです。

means_log_adj <- aggregate(lab_data[,delta_touse], 
    by = list(
     factor(mydata_adj$Response_EP, labels = c("non_responder", "responder")), 
     factor(mydata_adj$sex,labels = c("male","female")), 
     factor(mydata_adj$timepoint,labels = c("baseline","wk1","wk2","EP"))), 
    mean) 

Warning message: 
> mistake in factor 
> (mydata_adj$Response_EP, labels = 
> c("non-responder", "responder")): 
> invalid labels; length 2 should be 1 
> or 0. 

誰もが私の問題を解決するために私を助けてもらえますか？

Answer 1

いくつかの試行錯誤の末、私はあなたの問題を再現することができました。

しかし、Rのwarningとerrorの間に非常に重要な違いがあると言って始めます。問題を報告するときには、2つの間を明確に区別してください。あなたが存在しないレベルで再ラベルデータにfactor()を言っているので、

x <- letters[1:5] 
factor(x, labels=LETTERS[1:10]) 

Error in factor(x, labels = LETTERS[1:10]) : 
    invalid labels; length 10 should be 1 or 5 

このエラーが発生します。私は5つのレベルしか含まない変数に対して10個のラベルを指定しました。これは、ラベルとレベルが一致しないことを意味します。

最初は、Rは、レベルを決定しましょう、と単純にパラメータを指定せずにfactor(x)を呼び出すことです：

は、この問題を解決するには、2つの方法があります。 （推測では、これはあなたのコードで行われているべきものと考えられます。）：

factor(x) 
[1] a b c d e 
Levels: a b c d e 

秒labels、factor(x)とlevelsを指定しない呼び出すことです：

factor(x, levels=letters[1:10]) 
[1] a b c d e 
Levels: a b c d e f g h i j 

---

サンプルデータは提供されていないため、ソリューションをテストすることはできません。ただし、次のコードを試してください：

means_log_adj <- aggregate(lab_data[,delta_touse], 
    by = list(
     factor(mydata_adj$Response_EP,), 
     factor(mydata_adj$sex), 
     factor(mydata_adj$timepoint)), 
    mean)