私のnetworkxグラフにゼロ度のノードが表示されていません

Question

グラフを表示するためにネットワークライブラリを使って単純なpythonプログラムを作成しました。私は可視化のためにGraphvizを使用しました。ここ

コードここで

import networkx as nx 

from networkx.drawing.nx_pydot import write_dot 

G2 = nx.read_edgelist("test_input.txt",create_using=nx.DiGraph()) 



write_dot(G2,"test_flow.doc") 
diagram = 'print (os.system("D:/graphviz/bin/dot -o ' + output.svg + ' -Tsvg ' + test_flow.doc + '"))' 

exec(diagram) 

test_input

A 

B C 

B D 

D E 

Output from graphviz

である、私のドットファイルは、ノード "A" が格納されていません。

次数が0のノードは表示されません。誰かが私を助けてくれましたか？

Answer 1

以下は、networkxコードから直接得られたものです。ご覧のように、「path」だけがそのコマンドで読み取ることができます。 2つ未満の「単語」を含むすべての行は無視されます。ソースファイルから

：

for line in lines: 
    p=line.find(comments) 
    if p>=0: 
     line = line[:p] 
    if not len(line): 
     continue 
    # split line, should have 2 or more 
    s=line.strip().split(delimiter) 
    if len(s)<2: 
     continue 
    u=s.pop(0) 
    v=s.pop(0) 
    d=s 

この機能はparse_edgelistに実際にあります。関数read_edgelistは、私が投稿した関数のラッパーです。

私は最良の方法は手動でファイルを解析し、 "単一の"ノードを取得してグラフに手動で追加することだと思います。