qsubはshebangにもかかわらずcshでmy bashスクリプトを実行しています

Question

大学のSungridコンピューティングクラスタにbashスクリプトを送信して、実行可能ファイルをループで実行します。

$ echo $SHELL 
/bin/bash 

そして私は、私はqsubのに渡すスクリプトの先頭に、bashのシェバング、次のとおりです：私は、サーバーにログインすると、私はbashでよ

$ cat shell_sub 
#!/bin/bash 
#$ -N bSS_s13 
#$ -o logs/bSS_s13.log 
#$ -j y 
#$ -cwd 

echo $SHELL > shell.txt 

しかし、私は提出したときに上記のスクリプト：

qsub shell_sub 

それは代わりにCSHで実行されます。

$ cat shell.txt 
/bin/csh 

qshにcshの代わりにbashを強制的に実行させるにはどうすればいいですか？

Answer 1

サブミットしたジョブのシェルを（少なくともTorqueで）-Sを使用して設定できます。例えば

：qsub shell_sub -S /bin/bash

Answer 2

ほとんどの場合、あなたのキューがposix_compliantとしてshell_start_modeで構成されており、定義されたshellが（デフォルトで）/bin/cshとしてリストされています。これを確認するには

$ qconf -sq <name-of-queue> | grep shell 
shell     /bin/bash 
shell_start_mode  unix_behavior 

キュー名がわからない場合は、おそらくall.qです。

• shell_start_modeがposix_compliantであれば、シェバング行は無視され、ジョブが（それはバイナリとして提出されていない場合：-b y）shell設定によって定義されたシェルで開始されます。
  • なぜですか？ man pageから： "POSIXでは、重要なものとして '＃！/ bin/csh'のような最初のスクリプト行コメントは考慮されていません。したがって、バッチキューイングシステム（P1003.2d）のPOSIX標準では、代わりにユーザーが指定または設定したデフォルトのコマンドインタープリタを使用します。
• shell_start_modeがunix_behaviorの場合、ジョブのシェルを決定するためにシバンラインが使用されます。

キューの設定を変更することを管理者に依頼することができます。