2016-12-04 14 views
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にxの値を繰り返してプロット -は、だから私は、次のデータセットを持っているR

dat <- structure(list(cases = c(2L, 6L, 10L, 8L, 12L, 9L, 28L, 28L, 
36L, 32L, 46L, 47L), qrt = c(1L, 2L, 3L, 4L, 1L, 2L, 3L, 4L, 
1L, 2L, 3L, 4L), date = c(83, 83.25, 83.5, 83.75, 84, 84.25, 
84.5, 84.75, 85, 85.25, 85.5, 85.75)), .Names = c("cases", "qrt", 
"date"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -12L)) 


    cases qrt date 
    2 1  83.00 
    6 2  83.25 
    10 3  83.50 
    8 4  83.75 
    12 1  84.00 
    9 2  84.25 
    28 3  84.50 
    28 4  84.75 
    36 1  85.00 
    32 2  85.25 
    46 3  85.50 
    47 4  85.75 

あり、より多くのデータポイントがありますが、物事は、私はそれらを省略少し単純に見えるように。

そして、このデータセットに私はGLMに合わせています

fit <- glm(cases~date+qrt, family = poisson, data = dat) 

基本的に、私はこのGLMが、それはこのようになります生成し、この近似値のためのプロットを作成したいと思います(これは実際のためにプロットしたものです完全なデータセット、黒丸オリジナルデータと白丸が装着データであるれている)私が持っているだろうと仮定したX axis.I'mにQRT繰り返すx値と

enter image description here

ファンクションpredict()を使用する私はこれを試してみましたが、1,2,3,4,1,2,3,4などを繰り返す代わりに、x軸のx値が1から12になるようにしました。また、上のプロットのように、当てはめられた値に元のデータをどのようにプロットしますか?

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は、残念ながら、私はコードを持っていない、私はちょうど画像のプロットのように見えるためのものだということを知っています。 – tattybojangler

答えて

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難しくありません。ただ、軸の表示を制御するaxisを使用します。

## disable "x-axis" when `plot` fitted values 
## remember to set decent `ylim` for your plot 
plot(fit$fitted, xaxt = "n", xlab = "qtr", ylab = "cases", main = "GLM", 
    ylim = range(c(fit$fitted, dat$cases))) 
## manually add "x-axis", with "labels" and "las" 
axis(1, at = 1:12, labels = rep.int(1:4, 3), las = 2) 
## add original observed cases 
points(dat$cases, pch = 19) 

plot

あなたがここにpredictを使用する必要はありません。四半期の時系列にはギャップ/欠損値がないため、適合モデルfitの適合値が必要です。 ggplotと

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df <- rbind(data.frame(index=as.factor(1:nrow(dat)), value=dat$cases, cases='actual'), 
      data.frame(index=as.factor(1:nrow(dat)), value=predict(fit, type='response'), cases='predicted')) 
library(ggplot2) 
ggplot(df, aes(index, value, color=cases)) + geom_point(cex=3) + 
    scale_color_manual(values=c('black', 'gray')) + 
    scale_y_continuous(breaks=seq(0, max(df$value)+5, 5)) + theme_bw() 

enter image description here

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