2013-11-28 13 views
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S4汎用関数の評価引数をwithCallingHandlers()を使用してキャッチできない場合に警告が生成されました。 withCallingHandlersの正常な動作のS4メソッドの選択時に送信された警告をキャッチする方法

イラスト:これは中に発生していないことを示すために

### simplest method ever 
setGeneric('my_method', function(x) standardGeneric('my_method')) 
setMethod('my_method', 'ANY', function(x) str(x)) 

### call it with an argument that produces a warning: seems to work 
my_method(warning('argh')) 
# chr "argh" 
# Warning message: 
# argh 

### !!! BUT it is not caught !!!!!!!!!!!!!!!!!!: 
withCallingHandlers(my_method(warning('argh')), warning = function(w) 
    { stop('got warning:', w) }) 
# chr "argh" 
# Warning message: 
# argh 

最後の例:今すぐ

### simple function that sends a warning 
send_warning <- function() { 
    warning('send_warning') 
} 
send_warning() 
# Warning message: 
# In send_warning() : send_warning 

### the warning can be caught by withCallingHandlers 
withCallingHandlers(send_warning(), warning = function(w) 
    { stop('got warning:', w) }) 
# Error in (function (w) : 
# got warning:simpleWarning in send_warning(): send_warning 

、の警告がS4派遣中に放出されることにしましょうS4メソッドコール:

setGeneric('my_method2', function(x) standardGeneric('my_method2')) 
setMethod('my_method2', 'ANY', function(x) warning('my_method2')) 
my_method2() 
# Warning message: 
# In my_method2() : my_method2 

### warning is caught 
withCallingHandlers(my_method2(), warning = function(w) 
    { stop('got warning:', w) }) 
# Error in (function (w) : 
# got warning:simpleWarning in my_method2(): my_method2 

私が理解しているところでは、 S4の発送中に放出された警告の特殊な挙動。私はなぜ、どのようにそれらを捉えるかを知りたい。

+0

R-devメーリングリストで議論されている、これを見ているかどうかわかりません。 – Spacedman

答えて

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私の元の推測では、メソッドディスパッチが深く掘る警告

f = function(x) withCallingHandlers(x, warning=function(w) { 
    cat('muffled\n') 
    invokeRestart("muffleWarning") 
}) 

、その後

> withCallingHandlers(f(warning("f")), warning=function(w) message("caught")) 
muffled 

をマッフルためであるということでした、実際の警告コールは、このCのスタックトレースである

#0 do_warning (call=0x3d4ad50, op=0x9c4bf0, args=0x45b9968, rho=0x45b9c40) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/main/errors.c:1140 
#1 0x00000000004b4198 in bcEval (body=<optimized out>, rho=<optimized out>, useCache=<optimized out>) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/main/eval.c:4700 
#2 0x00000000004bff40 in Rf_eval (e=0x3d45618, rho=0x45b9c40) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/main/eval.c:554 
#3 0x00000000004c4e4d in Rf_applyClosure (call=0x45b8630, op=0x3d45730, arglist=<optimized out>, rho=0x9e7638, suppliedenv=0x9e7670) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/main/eval.c:1033 
#4 0x00000000004c0005 in Rf_eval (e=0x45b8630, rho=0x9e7638) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/main/eval.c:670 
#5 0x00000000004c0695 in forcePromise (e=0x45b9410) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/main/eval.c:458 
#6 0x00000000004c0462 in Rf_eval (e=0xa1d338, rho=0x45b9368) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/main/eval.c:577 
#7 0x000000000046fbfb in protectedEval (d=0x7fffffffc7f0) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/main/context.c:750 
#8 0x0000000000470d48 in R_ToplevelExec (fun=0x46fbe0 <protectedEval>, data=0x7fffffffc7f0) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/main/context.c:705 
#9 0x0000000000470de7 in R_tryEval (e=<optimized out>, env=<optimized out>, ErrorOccurred=0x7fffffffc89c) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/main/context.c:764 
#10 0x0000000000470e26 in R_tryEvalSilent (e=<optimized out>, env=<optimized out>, ErrorOccurred=<optimized out>) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/main/context.c:787 
#11 0x00007ffff49230b9 in R_dispatchGeneric (fname=0x44b37e8, ev=0x45b9368, fdef=0x45b92f8) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/library/methods/src/methods_list_dispatch.c:993 
#12 0x00000000004f5337 in do_standardGeneric (call=<optimized out>, op=<optimized out>, args=<optimized out>, env=0x45b9368) at /home/mtmorgan/src/R-devel/src/main/objects.c:1167 
.... 

ここで、CコードR_dispatchGenericのメソッドディスパッチはtryinです

998   if(check_err) 
999   error(_("error in evaluating the argument '%s' in selecting a method for function '%s': %s"), 
1000     CHAR(PRINTNAME(arg_sym)),CHAR(asChar(fname)), 
1001     R_curErrorBuf()); 

Rf_tryEvalSilentは、トップレベルでのようなものを評価します。これは、Cレベルのエラーハンドラを実装するために行われているようだ

それを評価して
989   if(arg_sym == R_dots) { 
990   thisClass = dots_class(ev, &check_err); 
991   } 
992   else { 
993   PROTECT(arg = R_tryEvalSilent(arg_sym, ev, &check_err)); 
994   if(!check_err) 
995    thisClass = R_data_class(arg, TRUE); 
996   UNPROTECT(1); /* for arg */ 
997   } 

を引数のクラスを把握するためにグラム呼び出しハンドラが確立されていないところのコマンドプロンプト。引数の評価がハンドラなしで起動するので、あなたはハンドラスタックはNULL

に設定されているCコード、
686 Rboolean R_ToplevelExec(void (*fun)(void *), void *data) 
687 { 
688  RCNTXT thiscontext; 
689  RCNTXT * volatile saveToplevelContext; 
690  volatile SEXP topExp, oldHStack; 
691  Rboolean result; 
692 
693 
694  PROTECT(topExp = R_CurrentExpr); 
695  PROTECT(oldHStack = R_HandlerStack); 
696  R_HandlerStack = R_NilValue; 
697  saveToplevelContext = R_ToplevelContext; 

でこれを見ることができ、回避策は

my_method(withCallingHandlers(warning('arrgh'), warning=function(w) ...)) 

かもしれないが、それはおそらく実用的ではありません。

+0

Rf_tryEvalSilentを実行する正当な理由があるかどうかは知っていますか?実際に呼び出し側のハンドラを使用しますか? –

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これらの質問は、実際には 'packageDescription(" methods ")$ Maintainer'(ここではあなたが既に尋ねているところ)によってのみ答えられますが、これはCレベルのエラーハンドラを追加するために実装されているようです!);エラーが発生した後、ユーザーに戻る前に、Cレベルのクリーンアップを実行することがあります。 –

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