genomicranges

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行でdata.tableにカスタム関数を適用すると、値

私はdata.tablesに新しいの一種だと私はこのようなDNAゲノム座標を含むテーブルを持っているの間違った金額を返します。 chrom pause strand coverage 1: 1 3025794 + 1 2: 1 3102057 + 2 3: 1 3102058 + 2 4: 1 3102078 + 1 5:

r data.table genomicranges 2017-01-10

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ウィンドウ全体のビン平均平均値

GRangesオブジェクトのメタ列の特定のウィンドウで平均値を求めようとしています。 だから私は、データオブジェクトを持っている： > gr.data GRanges object with 10505026 ranges and 1 metadata column: seqnames ranges strand | value <Rle> <IRang

r genomicranges 2016-12-01

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すべての値の組み合わせをPythonのペアごとの行の比較で繰り返します。

私は次の形式のゲノムビンを持つデータフレームを持っています。各ゲノム範囲は行として表され、細胞値はビンのその開始に対応する。 0 1 2 3 4 5 ... 522 0 9248 9249 NaN NaN NaN NaN ... NaN 1 17291 17292 17293 17294 17295 NaN ... NaN 2 18404 18405 18406 1840

python genomicranges 2017-05-10

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