Javaコードが印刷されないHashMapのキーと値

Question

私のコードは、ユーザー定義の文字列を入力し、それをDNA、RNA、またはODDとして分類します。出力はHashMap nucleotide_hmapのキーと値を出力するはずですが、コードは現在ありません。それが動作するように私のコードで何を変更すべきですか？ここ

が何であるかをコードすべき出力：

• ATGC
• 1（ユーザ入力シーケンスATGC場合）：0.25
• T 1：0.25
• C 1：0.25
• G 1：0.25
• 配列長：4
• 逆配列：C GTA
• 逆相補：GCAT

そして、これが私のサブクラスのいずれかです。

package sequenceclasses; 

public class DNASequence extends MainSequence { 
    public DNASequence(String dna_sequence){ 
     the_sequence = dna_sequence; 
     complement_hmap.put('A', 'T'); 
     complement_hmap.put('T', 'A'); 
     complement_hmap.put('C', 'G'); 
     complement_hmap.put('G', 'C'); 
    } 
    public void nuc_content(String dna_sequence){ 
     the_sequence = dna_sequence; 
     double[] counts_ratios = new double[8]; 
     for (int i = 0; i < dna_sequence.length(); i++){ 
      if (dna_sequence.charAt(i) == 'A'){ 
       counts_ratios[0] += 1;} 
      if (dna_sequence.charAt(i) == 'T'){ 
       counts_ratios[1] += 1;} 
      if (dna_sequence.charAt(i) == 'C'){ 
       counts_ratios[2] += 1;} 
      if (dna_sequence.charAt(i) == 'G'){ 
       counts_ratios[3] += 1;} 
      } 
      if (dna_sequence.length() > 0){ 
       counts_ratios[4] = counts_ratios[0]/dna_sequence.length(); 
       counts_ratios[5] = counts_ratios[1]/dna_sequence.length(); 
       counts_ratios[6] = counts_ratios[2]/dna_sequence.length(); 
       counts_ratios[7] = counts_ratios[3]/dna_sequence.length(); 
     }  
     String A_content = Double.toString(counts_ratios[0]) + " , " + Double.toString(counts_ratios[4]); 
     String T_content = Double.toString(counts_ratios[1]) + " , " + Double.toString(counts_ratios[5]); 
     String C_content = Double.toString(counts_ratios[2]) + " , " + Double.toString(counts_ratios[6]); 
     String G_content = Double.toString(counts_ratios[3]) + " , " + Double.toString(counts_ratios[7]); 

     nucleotide_hmap.put('A', A_content); 
     nucleotide_hmap.put('T', T_content); 
     nucleotide_hmap.put('C', C_content); 
     nucleotide_hmap.put('G', G_content); 
    } 
} 

Answer 1

あなたはDNA配列クラスのnuc_contentメソッドを呼び出すことはありません。これを解決するには、nuc_content(dna_sequence);行をDNASequenceクラスに追加します。コンストラクタは次のようになります。

public DNASequence(String dna_sequence){ 
     the_sequence = dna_sequence; 
     complement_hmap.put('A', 'T'); 
     complement_hmap.put('T', 'A'); 
     complement_hmap.put('C', 'G'); 
     complement_hmap.put('G', 'C'); 
     nuc_content(dna_sequence); 
    }