シルエットプロットが200行以上のデータに対して機能していない

Question

私のk-meansのシルエットを光沢を使ってプロットしようとしています。以下のコードの一部です：

dissE <- daisy(pima_diabetes_kmean[, c(input$models_to_consider)]) 
dE2 <- dissE^2 
sk2 <- silhouette(k.means.fit.knn()$cl, dE2) 
plot(sk2) 

それは、クラスタが不足している以下のプロット、その結果：

をしかし、私はデータの唯一の200行を使用するコードを変更した場合（またはwindow()を使用してください）、動作します。しかし、私は光沢を使っているので、別のウィンドウで私の結果を望んでいません。結果は残りの部分が同じページに表示されます。

dissE <- daisy(pima_diabetes_kmean[1:200, c(input$models_to_consider)]) 
dE2 <- dissE^2 
sk2 <- silhouette(k.means.fit.knn()$cl[1:200], dE2) 
plot(sk2) 

Answer 1

私は同じ問題がありました。私はそれをpfdファイルにエクスポートし、すべての観測値をその幅で見ることができました。私が試した観察の最大数は1148で、うまくいきました。