Rmarkdown Pandoc Issue

Question

私は、PDFをダウンロードするボタンを備えた光沢のあるダッシュボードの開発に取り組んできました。私は* .Rmd、ダッシュボードがうまく開発した0.99.902

• R 3.3.1
• RStudio：私は、次を使用して、私のWindows 7のマシン上でローカルに取り組んできましたファイルも同様に動作しますが、フォーマット作業を行うには少し時間がかかります。 header.texファイルを持つ書式設定のもの以外はすべて標準です。私は特別なパッケージなどを使用していません。

  最後に、このダッシュボードは、エンドユーザー向けにセットアップしたRedhat 6.8ボックスで実行する必要があります。私は次のようにインストールされている、このボックスには：

  • R 3.3.1（これはいくつかの標準的なtexliveの依存関係をインストールします）
  • Pandoc 1.9.4.1-1.1.el6

  私がいることを確認してきました必要なパッケージはすべてRインストール（rmarkdown、knitr、shinyなど）にインストールされています。

  * .Rmdファイルのレンダリング/ニットしようとしたときに私の問題が発生します。

  だから、

  > rmarkdown::render("pdfReport.Rmd") 
      Error: pandoc version 1.12.3 or higher is required and was not found (see the help page ?rmarkdown::pandoc_available). 
  

  は、多くの検索後、私はRedHatのレポ（および他のディストリビューション）がpandocの多くの古いバージョンを運ぶ傾向にあることがわかりました一方、RStudioのWindowsインストールには、必要なアイテムと互換性のあるpandoc.exeが付属しています。

  私の次の行動は、手動でpandocをインストールすることでした。私は以下のが見つかりました：

  http://pandoc.org/installing.html

  それはダウンロードして、スタックを経由してインストールを進めます。そこで私はHaskellプラットフォームとHaskellツールセットをインストールして "スタック"を取得しました。私はその後、この手順でいくつかの異なるバージョンのpandocをコンパイルしようとしましたが、何らの成功と大量のコンパイルエラーはありませんでした。言ったことの全てで

  は、次のいずれかの可能性である：

  1. 簡単にRedHatの6.8にpandocの現在のバージョン（1.12以降）をインストールしますか？ RPMはどこかにあるのでしょうか？
  2. 私が現在インストールしているインストールパラメータ（RHEL 6.8、R 3.3.1、およびpandoc 1.9.4.1）は連携して動作しますか？多分何らかのオーバーライド。

  ありがとうございます！

Answer 1

Pandoc 1.17は現在Fedora repoにあります。これはRedHatと互換性がありますか？

しかし、1.17はすでにかなり古いです。だから、compiling from sourceはあなたの最良の選択肢であってもよいし、stackを使用して、それはかなりストレートフォワードです：

git clone https://github.com/jgm/pandoc 
cd pandoc 
git submodule update --init # to fetch the templates 
stack setup     # to fetch ghc 
stack install