マルチファラファイルのfasta配列の末端から立体構造（*）を取り除く

Question

私は、2つのabinitioツールの予測されたタンパク質を含むmultifastaファイルを持っています。すべてのシーケンスには、最後に立体（*）が含まれています。私はファイルから削除したい。私のシーケンスは、このようなものです：

>snapgene1 
SFLPSAEAIEKVLSHMSRRIIDDMKAELQQPEMRWFWP* 
>snapgene2 
SFLPSAEAIEKVLSHIIIIAAAAKKKPPFFDDMKAELQQPEMRWFWP* 

私はこの様配列たい：

>snapgen1 
SFLPSAEAIEKVLSHMSRRIIDDMKAELQQPEMRWFWP 
>snapgene2 
SFLPSAEAIEKVLSHIIIIAAAAKKKPPFFDDMKAELQQPEMRWFWP 

は、誰もがこの中で私を助けることができます。ありがとう

Answer 1

テキストファイル "TEMP.TXT" に保存されている場合は、このコマンドを使用することができます。awkでは

sed -i "s/*$//" temp.txt 

Answer 2

、あなたがfileであなたのfastasを続ける場合：

$ awk '{sub(/\*$/,"")}1' file 
>snapgene1 
SFLPSAEAIEKVLSHMSRRIIDDMKAELQQPEMRWFWP 
>snapgene2 
SFLPSAEAIEKVLSHIIIIAAAAKKKPPFFDDMKAELQQPEMRWFWP 

それは置き換えられます末尾に*があります。