2017-12-13 9 views
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私はいくつかのPythonファイルを扱っていますが、解決できないエラーがあります。スクリプトは私のものではありませんが、作者は私に答えないでしょう。私は本当にこのスクリプトが必要です。Pythonスクリプトに関する問題。このファイルを修正する手助けをしてもらえますか?

ここにパッケージがあります:https://github.com/compbio-UofT/FSDA これはpython2.7で動作します。

私のエラーは次のとおりです。

1) vcfParser.py", line 30 
    print info[0]+"\t"+info[1]+"\t"+str(cA)+"\t"+str(cB)+"\t"+info[3]+"\t"+info[4]#+"\t"+dbsnpinfo[2] 
      ^
SyntaxError: invalid syntax 

2) rm: impossible to remove '/tmp//__tmp_reads_BAMFILE': File or directory don't exist 
3) cat: '/tmp//__frags_*_7028': File or directory don't exsit 
4) rm: impossible to remove '/tmp//__frags_*_7028': File or directory don't exsit 
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これを実行するPythonのバージョンはどれですか? ( 'python -V') – cdarke

答えて

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あなたが私にのpython3で、このスクリプトを実行しようとしているようだ...印刷機能はバージョン3に変更され、今では実行するために括弧を必要とし、このコードを与えるのでこの行のエラー。

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このスクリプトで私は './file.sh'を使いますが、python2.7やpython3.6を使ってみるとエラーが出ます。私は両方のバージョンのpythonを持っています。私はスクリプトを修正しようとしましたが、print関数の近くにかっこを挿入しましたが、私は他のエラーがあります。 – Pandora

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更新:ファイルを修正するためにもう一度試しましたが、まだこのエラーがあります:rm:impossibile rimuovere '/ tmp // __ tmp_reads_001_sample01_8211':ファイル以外のディレクトリodistente rm:impossibile rimuovere/tmp // __ tmp_reads_001_sample02_8211 ':ファイルoディレクトリnon esistente cat: '/ tmp // __ frags _ * _ 8211':ファイル以外のディレクトリ rm:不可解なリムーバー '/ tmp // __ frags _ * _ 8211':ディレクトリ以外のファイル アイデアはありますか? – Pandora

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