Pydot＆Graphviz setup

Question

私は、pythonでSKLearnを使ってgraphvizとpydotを使っていくつかの決定木をプロットしようとしています。 Pythonコードから ：

import numpy as np 
from sklearn.datasets import load_iris 
from sklearn import tree 
iris = load_iris(
clf = tree.DecisionTreeClassifier() 
clf = clf.fit(iris.data, iris.target) 
test_idx=[0,50,100] 

tree.export_graphviz(clf, 
     out_file='tree.dot')#gives text file 
print iris.feature_names 
print iris.target_names 
from sklearn.externals.six import StringIO 
import pydot 
dot_data = StringIO() 
tree.export_graphviz(clf, out_file=dot_data) 
graph = pydot.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue()) 
graph[0].write_pdf("iris.pdf") 

私はエラーを取得する：

Traceback (most recent call last): 
    File "/Users/student/Desktop/Data Structures/decision_tree_visualization.py", line 18, in <module> 
    graph[0].write_pdf("iris.pdf") 
    File "build/bdist.macosx-10.6-intel/egg/pydot.py", line 1691, in <lambda> 
    self.write(path, format=f, prog=prog)) 
    File "build/bdist.macosx-10.6-intel/egg/pydot.py", line 1774, in write 
    s = self.create(prog, format) 
    File "build/bdist.macosx-10.6-intel/egg/pydot.py", line 1883, in create 
    prog=prog)) 
Exception: "dot" not found in path. 

私は無駄にPYDOTとgraphvizのを再インストールしようとしています。どんな助け？

Answer 1

graphvizがシステムパスに追加されていないようです。 this Stack Overflow questionおよびthis more detailed explanationを参照してください。

すべてのインストール方法が、パスを正しく設定するわけではありません（特にpipインストール）。