特定の行の特定の文字で始まる単語を置き換える方法は？

Question

SEDコマンドを使用して、ファイルからrs番号を置き換えようとしています。私はドットでrs145599635交換したいと思います。例えば 、ONLY＃で始まらない行のエントリ*私はRSを交換したいと思います

##reference=file:/hs37d5.fasta 

#CHROM POS  ID  REF  ALT  QUAL FILTER INFO FORMAT SC_PCHD5235298 

1  10234 rs145599635  C  T  153.34 . 

： 私はVCFファイルを持っています。そして＃で始まる行であるヘッダを無視したい。

私は

sed "/^[^#]/s/rs.*/./g" test.vcf 

をしようとしたが、それは、RSの後、すべてを削除します。あなたはこれを試すことができ

Answer 1

、

例：

sed -i 's/\(^[^#].*\)rs[0-9]\+\(.*\)/\1rs.\2/' test.vcf 

は、私はあなたのcommand.Youは次のように記述する必要が変更されました。

sed -i "/^[^#]/s/rs[0-9]\+/rs./g" test.vcf 

私のtest.vcfファイルはこのように見えます。このファイルはこのように見えます。

##reference=file:/hs37d5.fasta 

    #rs145599635 C T 153.34 . 
    #1 10234 rs145599635 C T 153.34 . 
    #CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT SC_PCHD5235298 

    1 10234 rs145599635 C T 153.34 . 

これがあなたに役立つことを願っています。