特定の染色体ターゲットの反復ループ

Question

Imこれではかなり新しいので、どんな提案も歓迎します。

データフレームには、染色体の位置を示す3つの列と、染色体の位置の始まりと終わりを示す次の2つの列（つまり、chr1 1100 1200）があります。

最初の10行はchr1のデータを示しますが、その後はchr2などのデータがあります。

私はループを作成しました。私はそれをchr1行だけに適用したいと思います。そして、私はchr2のために同じことを繰り返すことを望みます。

これまでのところ、私はうまくいきませんでした：for（data.frame $ chr1のi）。

他の提案はありますか？

おかげ

Answer 1

あなたがsplit機能を使用することができます。それは染色体変数に沿って分割され、sapplyまたはlapply関数を使用して、各リスト要素（現在は個々の染色体のデータを保持しています）を反復処理できます。再現可能な例を提供する場合は、これを実装する方法を示すことは自明です。