Eucladion - BrayCurtisの測位結果を比較して、NMDSを使ってデータの直線性をチェックできますか？

Question

私はPCA（R）をしたいのですが、私のデータが線形かどうかは分かりません。 EucladianとBray-Curtisの距離でNMDSを実施しました。多数のゼロを含む1つの変数を除去した後、NMDSプロットはほぼ等しい。

私が仮定しているのは、線形データは非線形アラインメント空間（Bray-Curtis）でプロットされ、線形アラインメント空間（ユークリッド）でプロットされた線形データと同様の結果になります。この仮定は正当化されていますか？

ありがとうございます！

Answer 1

データの直線性/単峰性を判断するには、関数veganの機能を使用して、DCAを構築し、軸の長さを確認してください。as recommended here。