Irisデータセット(https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Iris)のSOMマッピングの視覚化を作成しようとしています。自己組織化マッププロットまたは虹彩データセットでのクラスラベルの可視化
私のコードは、これまでのところ:このマッピング生成
from sklearn.datasets import load_iris
from mvpa2.suite import *
import pandas as pd
import numpy as np
df = pd.read_csv(filepath_or_buffer='data/iris.data', header=None, sep=',')
df.columns=['sepal_len', 'sepal_wid', 'petal_len', 'petal_wid', 'class']
df.dropna(how="all", inplace=True) # drops the empty line at file-end
# split the data table into feature data x and class labels y
x = df.ix[:,0:4].values # the first 4 columns are the features
y = df.ix[:,4].values # the last column is the class label
t = np.zeros(len(y), dtype=int)
t[y == 'Iris-setosa'] = 0
t[y == 'Iris-versicolor'] = 1
t[y == 'Iris-virginica'] = 2
som = SimpleSOMMapper((240, 320), 100, learning_rate=0.05)
som.train(x)
pl.imshow(som.K, origin='lower')
mapped = som(x)
for i, m in enumerate(mapped):
pl.text(m[1], m[0], t[i], ha='center', va='center',
bbox=dict(facecolor='white', alpha=0.5, lw=0))
pl.show()
:
が、それはこの1つのように立派に見えるように、パレットをカスタマイズする方法はありますか? (https://github.com/JustGlowing/minisomから取得)?
基本的に私は(おそらく少ない色で)よりよいパレットを使用し、よりよい方法で、クラスラベルをマークしようとしています。
ありがとうございます。
質問はここにトピックオフになっている、それは私が私のデータをスライスするのを忘れたことが判明します。これは[SO]のトピックにあるように見えます。あなたが待っている場合は、そこに移行しようとします。 – gung
申し訳ありません私は実際に自己組織化マップを議論していないので、どの場所が適切かは分かりませんでした。お返事ありがとうございます –