circlizeでchordDiagramをプロットするときにエラーが発生しました： "circos.initializeのエラー"

Question

circlize（R）でchordDiagramをプロットしようとすると、永続エラーが発生します。私は1つのデータセット（Data1）でプロットを生成することはできますが、他の（Data2）とは構造的には同じです（私が知る限り）。両方のデータセットが下にコピーされます。彼らは同じ次元と構造を持っています - 私は思う！ 「Year」と「Month」は同じレベル数の要因として認識され、「平均」は数値です。両方のデータセットはRによってデータフレームとして認識されます。

私が手にエラーがある：
「circos.initializeにおけるエラー（因子=因子（ケイト、レベル=ケイト）、XLIM = CBIND（REP（0： xlimが行列であるので、それは同じなければなりませんfactorsのレベルの長さと2の列の数としての行数 "

私はthis投稿を見ましたが、そこの解決策は私を助けなかったので、私は別の問題を持っている必要があります..

require(circlize) 

データフレーム（ 'Data1'と 'Data2'）は、質問の最後にコピーされます。

のData1の作品 - プロットは、エラーなしで生成します。 を "：

head(Data1) 
Data1$Year <- as.factor(Data1$Year) 
str(Data1) 
# 'data.frame': 156 obs. of 3 variables: 
# $ Year : Factor w/ 13 levels "2003","2004",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 
# $ Month: Factor w/ 12 levels "Apr","Aug","Dec",..: 5 4 8 1 9 7 6 2 12 11. 
# $ mean : num 0 0 0 0 0 ... 

# Plot: 
chordDiagram(Data1) 

データ2は、データ2を使用してコードの第二部は、生成しプロットし、エラーに

head(Data2) 
Data2$Year <- as.factor(Data2$Year) 
str(Data2) 
# 'data.frame': 156 obs. of 3 variables: 
# $ Year : Factor w/ 13 levels "2003","2004",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 
# $ Month: Factor w/ 12 levels "Apr","Aug","Dec",..: 5 4 8 1 9 7 6 2 12 11  
# $ mean : num 0 0 0 0 0 ... 

# Plot 
chordDiagram(Data2) 

を与えていません（0、： ）xlimは行列ですので、レベルの長さはfactorsと同じでなければなりません。列の2.

アドバイスは非常に感謝して受け取ります！

おかげ

のData1：

Year Month  mean 
1 2003 Jan 0.00000000 
2 2003 Feb 0.00000000 
3 2003 Mar 0.00000000 
4 2003 Apr 0.00000000 
5 2003 May 0.00000000 
6 2003 Jun 51.25480924 
7 2003 Jul 52.86618015 
8 2003 Aug 18.73057776 
9 2003 Sep 30.78747020 
10 2003 Oct 24.64436457 
11 2003 Nov 65.18283156 
12 2003 Dec 5.26012515 
13 2004 Jan 4.54277226 
14 2004 Feb 6.48744396 
15 2004 Mar 18.51936027 
16 2004 Apr 20.62421203 
17 2004 May 10.52632961 
18 2004 Jun 0.00000000 
19 2004 Jul 2.07228430 
20 2004 Aug 1.42555995 
21 2004 Sep 0.00000000 
22 2004 Oct 0.00000000 
23 2004 Nov 0.00000000 
24 2004 Dec 0.32547699 
25 2005 Jan 1.66109048 
26 2005 Feb 0.61855670 
27 2005 Mar 3.44998035 
28 2005 Apr 2.59668067 
29 2005 May 0.36585366 
30 2005 Jun 0.36258235 
31 2005 Jul 6.59261048 
32 2005 Aug 6.74112309 
33 2005 Sep 3.26467331 
34 2005 Oct 5.03515889 
35 2005 Nov 12.43620184 
36 2005 Dec 0.77694983 
37 2006 Jan 0.00000000 
38 2006 Feb 0.39627929 
39 2006 Mar 0.77348066 
40 2006 Apr 1.27516779 
41 2006 May 0.11111111 
42 2006 Jun 0.00000000 
43 2006 Jul 11.54743590 
44 2006 Aug 12.46652756 
45 2006 Sep 8.53900709 
46 2006 Oct 0.00000000 
47 2006 Nov 2.87531133 
48 2006 Dec 4.86021505 
49 2007 Jan 0.74007156 
50 2007 Feb 0.00000000 
51 2007 Mar 0.60000000 
52 2007 Apr 0.00000000 
53 2007 May 0.53333333 
54 2007 Jun 0.00000000 
55 2007 Jul 4.36056332 
56 2007 Aug 0.00000000 
57 2007 Sep 3.72926026 
58 2007 Oct 4.91828416 
59 2007 Nov 7.32487797 
60 2007 Dec 0.00000000 
61 2008 Jan 5.88456083 
62 2008 Feb 0.00000000 
63 2008 Mar 1.14460094 
64 2008 Apr 0.00000000 
65 2008 May 0.00000000 
66 2008 Jun 0.00000000 
67 2008 Jul 0.00000000 
68 2008 Aug 1.01011920 
69 2008 Sep 2.61201413 
70 2008 Oct 0.00000000 
71 2008 Nov 0.00000000 
72 2008 Dec 0.00000000 
73 2009 Jan 5.74589612 
74 2009 Feb 0.00000000 
75 2009 Mar 2.42530066 
76 2009 Apr 0.00000000 
77 2009 May 2.28169014 
78 2009 Jun 0.00000000 
79 2009 Jul 3.37186343 
80 2009 Aug 0.00000000 
81 2009 Sep 9.67179487 
82 2009 Oct 0.00000000 
83 2009 Nov 4.00091324 
84 2009 Dec 4.99561129 
85 2010 Jan 0.00000000 
86 2010 Feb 2.02962604 
87 2010 Mar 0.11764706 
88 2010 Apr 0.00000000 
89 2010 May 1.38919826 
90 2010 Jun 1.46666667 
91 2010 Jul 0.47246377 
92 2010 Aug 0.00000000 
93 2010 Sep 0.00000000 
94 2010 Oct 4.40459770 
95 2010 Nov 0.00000000 
96 2010 Dec 0.00000000 
97 2011 Jan 0.40000000 
98 2011 Feb 0.00000000 
99 2011 Mar 0.00000000 
100 2011 Apr 1.07972802 
101 2011 May 0.00000000 
102 2011 Jun 0.60277778 
103 2011 Jul 10.82795699 
104 2011 Aug 7.09462366 
105 2011 Sep 1.24684685 
106 2011 Oct 0.00000000 
107 2011 Nov 3.65154853 
108 2011 Dec 0.00000000 
109 2012 Jan 1.28210424 
110 2012 Feb 0.00000000 
111 2012 Mar 1.77027890 
112 2012 Apr 0.00000000 
113 2012 May 2.00831169 
114 2012 Jun 6.44055944 
115 2012 Jul 11.02296928 
116 2012 Aug 0.00000000 
117 2012 Sep 9.22877123 
118 2012 Oct 0.00000000 
119 2012 Nov 2.37818182 
120 2012 Dec 0.00000000 
121 2013 Jan 2.34805195 
122 2013 Feb 0.00000000 
123 2013 Mar 0.00000000 
124 2013 Apr 3.43796837 
125 2013 May 2.79489914 
126 2013 Jun 3.97525791 
127 2013 Jul 17.69100716 
128 2013 Aug 0.00000000 
129 2013 Sep 24.65628317 
130 2013 Oct 0.00000000 
131 2013 Nov 6.90997527 
132 2013 Dec 0.00000000 
133 2014 Jan 0.00000000 
134 2014 Feb 2.17611657 
135 2014 Mar 0.77922078 
136 2014 Apr 0.00000000 
137 2014 May 2.05913758 
138 2014 Jun 1.23313580 
139 2014 Jul 2.17882118 
140 2014 Aug 0.00000000 
141 2014 Sep 1.55084316 
142 2014 Oct 0.00000000 
143 2014 Nov 0.77922078 
144 2014 Dec 0.00000000 
145 2015 Jan 0.00000000 
146 2015 Feb 0.07633588 
147 2015 Mar 0.00000000 
148 2015 Apr 0.39958534 
149 2015 May 1.95279500 
150 2015 Jun 0.00000000 
151 2015 Jul 6.69971250 
152 2015 Aug 11.42582933 
153 2015 Sep 11.28810414 
154 2015 Oct 0.00000000 
155 2015 Nov 3.97264445 
156 2015 Dec 0.00000000 

データ2：

Year Month  mean 
1 2003 Jan 0.0000000 
2 2003 Feb 0.0000000 
3 2003 Mar 0.0000000 
4 2003 Apr 0.0000000 
5 2003 May 0.0000000 
6 2003 Jun 0.0000000 
7 2003 Jul 0.0000000 
8 2003 Aug 0.0000000 
9 2003 Sep 0.0000000 
10 2003 Oct 2.2222222 
11 2003 Nov 3.3333333 
12 2003 Dec 17.7777778 
13 2004 Jan 0.0000000 
14 2004 Feb 0.0000000 
15 2004 Mar 0.0000000 
16 2004 Apr 1.1111111 
17 2004 May 23.5609103 
18 2004 Jun 42.2757697 
19 2004 Jul 42.5814536 
20 2004 Aug 29.6251673 
21 2004 Sep 8.8888889 
22 2004 Oct 4.4444444 
23 2004 Nov 3.3333333 
24 2004 Dec 3.3333333 
25 2005 Jan 0.0000000 
26 2005 Feb 0.0000000 
27 2005 Mar 0.0000000 
28 2005 Apr 0.0000000 
29 2005 May 149.3280106 
30 2005 Jun 6.6666667 
31 2005 Jul 64.4444444 
32 2005 Aug 18.8888889 
33 2005 Sep 20.0000000 
34 2005 Oct 7.7777778 
35 2005 Nov 5.0000000 
36 2005 Dec 2.2222222 
37 2006 Jan 0.0000000 
38 2006 Feb 0.0000000 
39 2006 Mar 0.0000000 
40 2006 Apr 0.0000000 
41 2006 May 2.2222222 
42 2006 Jun 66.6666667 
43 2006 Jul 26.6666667 
44 2006 Aug 25.5555556 
45 2006 Sep 11.1111111 
46 2006 Oct 4.4444444 
47 2006 Nov 2.2222222 
48 2006 Dec 17.7777778 
49 2007 Jan 0.0000000 
50 2007 Feb 0.0000000 
51 2007 Mar 0.0000000 
52 2007 Apr 0.0000000 
53 2007 May 53.3333333 
54 2007 Jun 36.6666667 
55 2007 Jul 26.6666667 
56 2007 Aug 0.0000000 
57 2007 Sep 0.0000000 
58 2007 Oct 0.0000000 
59 2007 Nov 0.0000000 
60 2007 Dec 0.0000000 
61 2008 Jan 0.0000000 
62 2008 Feb 0.0000000 
63 2008 Mar 0.0000000 
64 2008 Apr 0.0000000 
65 2008 May 0.0000000 
66 2008 Jun 0.0000000 
67 2008 Jul 0.0000000 
68 2008 Aug 0.0000000 
69 2008 Sep 0.0000000 
70 2008 Oct 0.0000000 
71 2008 Nov 0.0000000 
72 2008 Dec 0.0000000 
73 2009 Jan 0.0000000 
74 2009 Feb 0.0000000 
75 2009 Mar 1.1111111 
76 2009 Apr 9.4444444 
77 2009 May 18.3333333 
78 2009 Jun 18.8888889 
79 2009 Jul 17.7777778 
80 2009 Aug 22.2222222 
81 2009 Sep 8.3333333 
82 2009 Oct 13.8888889 
83 2009 Nov 15.0000000 
84 2009 Dec 13.8888889 
85 2010 Jan 0.0000000 
86 2010 Feb 0.0000000 
87 2010 Mar 0.0000000 
88 2010 Apr 0.0000000 
89 2010 May 11.6666667 
90 2010 Jun 17.2222222 
91 2010 Jul 3.3333333 
92 2010 Aug 0.0000000 
93 2010 Sep 0.0000000 
94 2010 Oct 0.0000000 
95 2010 Nov 0.0000000 
96 2010 Dec 0.0000000 
97 2011 Jan 0.0000000 
98 2011 Feb 0.0000000 
99 2011 Mar 0.0000000 
100 2011 Apr 5.9259259 
101 2011 May 93.3333333 
102 2011 Jun 10.3703704 
103 2011 Jul 19.2592593 
104 2011 Aug 14.8148148 
105 2011 Sep 1.4814815 
106 2011 Oct 3.7037037 
107 2011 Nov 14.0740741 
108 2011 Dec 11.8518519 
109 2012 Jan 0.0000000 
110 2012 Feb 0.0000000 
111 2012 Mar 0.0000000 
112 2012 Apr 184.4444444 
113 2012 May 274.0740741 
114 2012 Jun 37.0370370 
115 2012 Jul 17.7777778 
116 2012 Aug 0.0000000 
117 2012 Sep 7.4074074 
118 2012 Oct 12.5925926 
119 2012 Nov 19.2592593 
120 2012 Dec 28.8888889 
121 2013 Jan 0.0000000 
122 2013 Feb 0.0000000 
123 2013 Mar 0.7407407 
124 2013 Apr 1.4814815 
125 2013 May 11.8518519 
126 2013 Jun 62.2222222 
127 2013 Jul 20.0000000 
128 2013 Aug 33.3333333 
129 2013 Sep 17.0370370 
130 2013 Oct 0.0000000 
131 2013 Nov 0.0000000 
132 2013 Dec 0.0000000 
133 2014 Jan 0.0000000 
134 2014 Feb 0.0000000 
135 2014 Mar 0.0000000 
136 2014 Apr 0.0000000 
137 2014 May 0.0000000 
138 2014 Jun 0.0000000 
139 2014 Jul 0.0000000 
140 2014 Aug 0.0000000 
141 2014 Sep 0.0000000 
142 2014 Oct 0.0000000 
143 2014 Nov 0.0000000 
144 2014 Dec 0.0000000 
145 2015 Jan 0.0000000 
146 2015 Feb 0.0000000 
147 2015 Mar 0.0000000 
148 2015 Apr 0.0000000 
149 2015 May 0.0000000 
150 2015 Jun 0.0000000 
151 2015 Jul 0.0000000 
152 2015 Aug 0.0000000 
153 2015 Sep 0.0000000 
154 2015 Oct 0.0000000 
155 2015 Nov 0.0000000 
156 2015 Dec 0.0000000 

Answer 1

私は（GitHubの上でのみ利用可能）circlize 0.4.0との両方のデータセットを試してみましたが、両方ともOKです。 Data2、Jan、Feb、Marにゼロがあり、エラーが発生する可能性があります（円から3か月が削除されていますが、xlimの行を調整するのを忘れていました）。この問題は最新のバージョンで修正されており、devtools::install_github("jokergoo/circlize")で更新できます。