GAEでQuercusを使用してPHPアプリケーションを実行することはできますが、一般的なCakePHPアプリケーションを動作させることは不満の念を抱くことでしょう。あなたが知っている限り、GAEのデータストア用のPDOドライバはありませんので、独自のCakePHP DataSourceを作成する必要があります。また、GAEはファイルシステムへのアクセスをサポートしていないので、あなたがケーキで引き継いだもの(ファイルシステムに基づくキャッシュなど)はGAEでは正しく動作しません。
"クラウド内で" CakePHPアプリケーションを実行する場合は、PHPを適切にサポートするサービス(例:RackSpace Cloud、PHPFog、PagodaBoxなど)を使用することを検討してください。
アドオンの質問と言えば、従来のホストされたアプリケーションのアーキテクチャは真の「クラウドアプリケーション」とわずかに異なります。具体的には、クラウドアプリケーションはscale horizontallyに設計されています。これは複雑なトピックですので、概念を理解するためにクラウドアプリケーションアーキテクチャについて独自の調査を行うことをお勧めします。
[Google App EngineはPHPをサポートしていますか?](http://stackoverflow.com/q/2559497/367456?rq=1) – hakre