>で始まる行を> awkコマンドで同じ行の15列に置き換えるには？

Question

私はこのようなファイルを持っている：

私はその第15回コラムで >で始まるすべての行を置き換えたい

>gi|358482566|ref|NW_003766328.1| Gallus gallus breed Red Jungle fowl, inbred line UCD001 unplaced genomic scaffold, Gallus_gallus-4.0 ChrUn_7180000961607, whole genome shotgun sequence 
TCTGTCTCTTGTCACTGTATTGTAGTGTGAACCCCTTAAAGGGAAGACCTGCTCTCCTTTGAAAATGCTT 
GCTCATCTATATGCCTCATGCATACCCTCACTGGCAAAGGAGAGCTGAAGTAATTTTAGGACAGAGGAGT 
ACTAGATTGTA 
>gi|358482565|ref|NW_003766329.1| Gallus gallus breed Red Jungle fowl, inbred line UCD001 unplaced genomic scaffold, Gallus_gallus-4.0 ChrUn_7180000961609, whole genome shotgun sequence 
TTTGACCAATGCATTTCAGCATGTTTTTTGACACTAGGTATGCCATTTGGGATGACAATATCAGTTTCCA 
TTTCCATTAGAGGAAAATAAGGTT 

。私が知らないことは、行を列で置き換える方法です。その行のすべての列を15行目に置き換えようとしていました。

ので、私が出力されたとして持っていることを期待するもの：

 >ChrUn_7180000961607 
    TCTGTCTCTTGTCACTGTATTGTAGTGTGAACCCCTTAAAGGGAAGACCTGCTCTCCTTTGAAAATGCTT 
    GCTCATCTATATGCCTCATGCATACCCTCACTGGCAAAGGAGAGCTGAAGTAATTTTAGGACAGAGGAGT 
    ACTAGATTGTA 
    >ChrUn_7180000961609 
    TTTGACCAATGCATTTCAGCATGTTTTTTGACACTAGGTATGCCATTTGGGATGACAATATCAGTTTCCA 
    TTTCCATTAGAGGAAAATAAGGTT 

これらは私のコマンドです：

awk '{if ($1 ~ />/) for (i=1; i<=19; i++) gsub ($i, $15)}' 
test.fa 

私はこれを使用するとき、私は私が望むものではないファイルにいくつかの変更を取得しますが、 !!カラム15は取り外される！

awk '{if ($1 ~ />/) for (i=1; i<=19; i++) a= $15 gsub($i, a)}' 
gga_ref_Gallus_gallus-4.0_unplaced.fa 

これを使用すると、このエラーが発生します。

awk: (FILENAME=gga_ref_Gallus_gallus-4.0_unplaced.fa FNR=1) fatal: sub_common: buf: can't allocate 521711124992 bytes of memory (Cannot allocate memory) 

はので、私は、2つの第15回コラムと * >で始まる行LL * を交換で欲しいと私はしたいものをまだ初めで>持っています！

Answer 1

私は、これはあなたがやりたいだろうと思う：

awk '$0 ~ /^>/ { print ">" $15; next } 1' 

それは>変わらないと始まらないすべての行を残します。これは、nextを使用して、>で始まる行の場合に次のレコードにスキップするようにawkに指示することによって達成されます。 1は常に真であるため、>で始まらない行に対しては、行を印刷するデフォルトの動作が呼び出されます。

Answer 2

これはあなたのために働くかもしれません：あなたは15日、フィールドの一部であるカンマについて

sed 's/^\(\s*\)>\(\S*\s*\)\{15\}.*/\1\2/;s/,\s*$//' file