2017-12-12 30 views
2

私はPythonを使用して3DSlicerでエクステンションプログラミングを始めようとしています。 オンラインでa tutorialがあります。残念ながら、3番目のサンプルスクリプト "HelloSharpen"には問題があります。私は、彼らがした、まったく同じことをしたが、私はこのエラーを取得:"GetImage"と "Update"のVTKが変更されました

Traceback (most recent call last): 
    File "C:/Users/johan/Desktop/HelloPythonSlicer4/helloPython/code/HelloSharpen.py", line 105, in onApply 
    laplacian.SetInput(inputVolume.GetImageData()) 
AttributeError: 'vtkImagingGeneralPython.vtkImageLaplacian' object has no attribute 'SetInput' 

私は、彼らがVTKの新しいバージョンでこれを変更することを読んでいるので、私はlaplacian.SetInputData(inputVolume.GetImageData())laplacian.SetInput(inputVolume.GetImageData())を変更することでこれを解決しました。

は、しかし、私は新しいエラーにこれを実行しようとすると起動します:

Traceback (most recent call last): 
    File "C:/Users/johan/Desktop/HelloPythonSlicer4/helloPython/code/HelloSharpen.py", line 107, in onApply 
    laplacian.GetOutput().Update() 
AttributeError: 'vtkCommonDataModelPython.vtkImageData' object has no attribute 'Update' 

laplacian.GetOutput().Update()が問題を引き起こしているようだ、彼らはまた、新しいバージョンでこれを変更した場合、私は、インターネット上で何かを見つけることを試みた ので、私は何かを見つけることができませんでした。私はこれを "UpdateData"に変更しようとしましたが、これは機能しません。 彼らもこれを変更したかどうか知っていますか?もしそうなら、私はこれを何に置き換えるべきかを知っていますか?

ここで "HelloSharpen" の完全なコードです:

from __main__ import vtk, qt, ctk, slicer 

# 
# HelloSharpen 
# 

class HelloSharpen: 
    def __init__(self, parent): 
    parent.title = "Hello Python Part D - Sharpen" 
    parent.categories = ["Examples"] 
    parent.dependencies = [] 
    parent.contributors = ["Jean-Christophe Fillion-Robin (Kitware)", 
          "Steve Pieper (Isomics)", 
          "Sonia Pujol (BWH)"] # replace with "Firstname Lastname (Org)" 
    parent.helpText = """ 
    Example of scripted loadable extension for the HelloSharpen tutorial. 
    """ 
    parent.acknowledgementText = """ 
    This file was originally developed by Jean-Christophe Fillion-Robin, Kitware Inc., 
Steve Pieper, Isomics, Inc., and Sonia Pujol, Brigham and Women's Hospital and was 
partially funded by NIH grant 3P41RR013218-12S1 (NAC) and is part of the National Alliance 
for Medical Image Computing (NA-MIC), funded by the National Institutes of Health through the 
NIH Roadmap for Medical Research, Grant U54 EB005149.""" # replace with organization, grant and thanks. 
    self.parent = parent 

# 
# qHelloPythonWidget 
# 

class HelloSharpenWidget: 
    def __init__(self, parent = None): 
    if not parent: 
     self.parent = slicer.qMRMLWidget() 
     self.parent.setLayout(qt.QVBoxLayout()) 
     self.parent.setMRMLScene(slicer.mrmlScene) 
    else: 
     self.parent = parent 
    self.layout = self.parent.layout() 
    if not parent: 
     self.setup() 
     self.parent.show() 

    def setup(self): 
    # Collapsible button 
    self.laplaceCollapsibleButton = ctk.ctkCollapsibleButton() 
    self.laplaceCollapsibleButton.text = "Sharpen Operator" 
    self.layout.addWidget(self.laplaceCollapsibleButton) 

    # Layout within the laplace collapsible button 
    self.laplaceFormLayout = qt.QFormLayout(self.laplaceCollapsibleButton) 

    # 
    # the volume selectors 
    # 
    self.inputFrame = qt.QFrame(self.laplaceCollapsibleButton) 
    self.inputFrame.setLayout(qt.QHBoxLayout()) 
    self.laplaceFormLayout.addWidget(self.inputFrame) 
    self.inputSelector = qt.QLabel("Input Volume: ", self.inputFrame) 
    self.inputFrame.layout().addWidget(self.inputSelector) 
    self.inputSelector = slicer.qMRMLNodeComboBox(self.inputFrame) 
    self.inputSelector.nodeTypes = (("vtkMRMLScalarVolumeNode"), "") 
    self.inputSelector.addEnabled = False 
    self.inputSelector.removeEnabled = False 
    self.inputSelector.setMRMLScene(slicer.mrmlScene) 
    self.inputFrame.layout().addWidget(self.inputSelector) 

    self.outputFrame = qt.QFrame(self.laplaceCollapsibleButton) 
    self.outputFrame.setLayout(qt.QHBoxLayout()) 
    self.laplaceFormLayout.addWidget(self.outputFrame) 
    self.outputSelector = qt.QLabel("Output Volume: ", self.outputFrame) 
    self.outputFrame.layout().addWidget(self.outputSelector) 
    self.outputSelector = slicer.qMRMLNodeComboBox(self.outputFrame) 
    self.outputSelector.nodeTypes = (("vtkMRMLScalarVolumeNode"), "") 
    self.outputSelector.setMRMLScene(slicer.mrmlScene) 
    self.outputFrame.layout().addWidget(self.outputSelector) 

    self.sharpen = qt.QCheckBox("Sharpen", self.laplaceCollapsibleButton) 
    self.sharpen.toolTip = "When checked, subtract laplacian from input volume" 
    self.sharpen.checked = True 
    self.laplaceFormLayout.addWidget(self.sharpen) 


    # Apply button 
    laplaceButton = qt.QPushButton("Apply") 
    laplaceButton.toolTip = "Run the Laplace or Sharpen Operator." 
    self.laplaceFormLayout.addWidget(laplaceButton) 
    laplaceButton.connect('clicked(bool)', self.onApply) 

    # Add vertical spacer 
    self.layout.addStretch(1) 

    # Set local var as instance attribute 
    self.laplaceButton = laplaceButton 

    def onApply(self): 
    inputVolume = self.inputSelector.currentNode() 
    outputVolume = self.outputSelector.currentNode() 
    if not (inputVolume and outputVolume): 
     qt.QMessageBox.critical(
      slicer.util.mainWindow(), 
      'Sharpen', 'Input and output volumes are required for Laplacian') 
     return 
    # run the filter 
    laplacian = vtk.vtkImageLaplacian() 
    laplacian.SetInputData(inputVolume.GetImageData()) 
    laplacian.SetDimensionality(3) 
    laplacian.GetOutput().Update() 
    ijkToRAS = vtk.vtkMatrix4x4() 
    inputVolume.GetIJKToRASMatrix(ijkToRAS) 
    outputVolume.SetIJKToRASMatrix(ijkToRAS) 
    outputVolume.SetAndObserveImageData(laplacian.GetOutput()) 

    # optionally subtract laplacian from original image 
    if self.sharpen.checked: 
     parameters = {} 
     parameters['inputVolume1'] = inputVolume.GetID() 
     parameters['inputVolume2'] = outputVolume.GetID() 
     parameters['outputVolume'] = outputVolume.GetID() 
     slicer.cli.run(slicer.modules.subtractscalarvolumes, None, parameters, wait_for_completion=True) 

    selectionNode = slicer.app.applicationLogic().GetSelectionNode() 
    selectionNode.SetReferenceActiveVolumeID(outputVolume.GetID()) 
    slicer.app.applicationLogic().PropagateVolumeSelection(0) 

答えて

2

TLは、DRlaplacian.Update()に変更laplacian.GetOutput().Update()

説明: thisリンクあたりのように、要約するVTK 6に導入され、主要な変化、VTKの新しいバージョンが分離しているアルゴリズムおよび2つの異なるクラス階層のデータがありました。 VTKの新しいバージョンでは、Update()関数は、vtkAlgorithmクラスから派生したオブジェクトに対してのみ呼び出すことができます。 vtkImageLaplacianhereの継承ダイアグラムを見ることができます。これは確かにvtkAlgorithmクラスから派生したものです。だからlaplacian.Update()が動作します。

名前からわかるように、vtkImageDataはデータオブジェクトです。 laplacian.GetOutput()vtkImageDataオブジェクトを返します。そのため、Update()関数を呼び出すことができないため、エラーが発生します。

+0

ありがとうございました! – Ineedhelpbecauseiamstupid

関連する問題