検索見つかった場合（BASH）

Question

私は次のリストがあります

COX1 
    COX1 
    COX1 
    COX1 
    COX1 
    Cu-oxidase 
    Cu-oxidase_3 
    Cu-oxidase_3 
    Fer4_NifH 

を、私はCOX1とCu-oxidaseがリストにある場合は、検索したい、私はCu-oxidase_3場合、xyzを印刷したいとFer4_NifHは、最初の2つがリストにある場合、それはabcを独立して印刷する必要があります（あまりにもリストに含まれている

これは私がこれまでのスクリプトができるもの：。

if grep 'COX1' file.txt; then echo xyz; else exit 0; fi

ですが、もちろん不完全です。 これに対する解決策はありますか？

理想的に私の出力は次のようになります。

xyz 
abc 

Answer 1

上記は、これを達成するために非常に冗長な方法です。そこ少ないif Sと同じと少ないgrep秒を書くための方法がありますが、私は本当にあなたのロジックを見せたかった：

あなたはgrepコマンドを実行し、$?とその戻り値をチェックし、最終的に条件に作用します。

# default values 
HAS_COX1=0 
HAS_CUOX=0 
HAS_CUO3=0 
HAS_FER4=0 

# run silently grep 
grep -q 'COX1' file.txt 
# check for return value and set variable accordingly 
if [ $? -eq 0 ]; then HAS_COX1=1; fi 

# same as above 
grep -q 'Cu-oxidase' file.txt 
if [ $? -eq 0 ]; then HAS_CUOX=1; fi 
grep -q 'Cu-oxidase_3' file.txt 
if [ $? -eq 0 ]; then HAS_CUO3=1; fi 
grep -q 'Fer4_NifH' file.txt 
if [ $? -eq 0 ]; then HAS_FER4=1; fi 

if [ $HAS_COX1 -eq 1 ]; then 
    if [ $HAS_CUOX -eq 1 ]; then 
    echo 'xyz' 
    exit 0 
    fi 
fi 

if [ $HAS_CUO3 -eq 1 ]; then 
    if [ $HAS_FER4 -eq 1 ]; then 
    echo 'abc' 
    exit 0 
    fi 
fi 

echo 'None of the checks where matched' 
exit 1 

用心：をこのコードはテストされていないので、

☺コードのバグがあるかもしれません両方の条件が満たされたとき、それは'xyz'と'abc'の両方を印刷することはできません（それと同じように、完璧ではありません私が提供する構文で簡単に修正することができます）。また$HAS_CUOXは$HAS_CUO3が見つかるたびに1に設定されます（grep正規表現では境界チェックなし）。

grepの正規表現として'COX1\|Cu_oxidase'のようなものを使用してチェックするために、条件のセットごとに1つのgrepを使用して、さらにコードを実行することができます。また、上記のマイナーな問題を修正してください。

---

理想的に私の出力は次のようになります。 xyz abc

私は上記のスクリプトを書いた後、あなたはあなたの予想される出力を追加しましたが、私はあなたを与えた要素を与え、あなたのことができるようになりどのように改善するかを理解する（基本的には、私が配置したexit 0を削除し、出力がない場合はexit 1を実行する）

または汚れた溶液としてすべてexitを取り除くだけです。

Answer 2

Awkを使用すると、複数の正規表現を簡単に検索し、一致した文字列以外のものを簡単に印刷できます。 （grepは複数のパターンも簡単に検索できますが、任意の文字列ではなく、一致またはその行番号またはファイル名を出力します）。

以下は、1行に1つのトークンがあることを前提としています。この仮定はスクリプトを本当にシンプルにしますが、他のシナリオをサポートすることも難しくありません。それは、ファイル内のすべての行を読み取ったときは、各トークン（各ライン上の実際最初の空白で区切られたトークン）の連想配列を構築した後、端部で

awk '{ a[$1]++ } 
    END { if (("COX1" in a) && ("Cu-oxidase" in a)) print "xyz"; 
     if (("Cu-oxidase_3" in a) && ("Fer4_NifH" in a)) print "abc" }' file.txt 

、求めトークンとして存在するか否かをチェック配列内のキー。

大きな入力ファイルと多数のパターンがある場合は、入力ファイルを1回だけ通過させるのが大きなメリットです。完全性のために、grepで複数のパスを実行する構文は非常に簡単です。さらに

grep -qx 'COX1' file.txt && grep -qx 'Cu-oxidase' file.txt && echo xyz 

Noticeを一致させるために全体の線を必要とする-xスイッチ（'Cu-oxidase'ものCu-oxidase_3行に一致し、さもなければ、正規表現）を省略でき

if grep -qx 'COX1' file.txt && grep -qx 'Cu-oxidase' file.txt 
then 
    echo xyz 
fi 

。