2016-12-12 7 views
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海域のアラゴナイト飽和レベルを表すラスタからデータを指すために、排他的経済圏を割り当てたいと考えています。 ラスタは、海洋の多くの緯度/経度ポイントに対してアラゴナイト値を与える単一のレイヤです。 排他的経済水域に各緯度/経度のポイントを割り当てたいと思います。 This siteは、座標の単一ペアのためにそれをしないが、私は、データが次のようになりR.Rのcoords2country関数を国境でない排他的経済圏で使用する

でそれを行うことが可能である期待していますので、私は15,000ポイントを持っている:

 long  lat Aragonite 
1 20.89833 84.66917 1.542071 
2 22.69496 84.66917 1.538187 
3 24.49159 84.66917 1.537830 
4 26.28822 84.66917 1.534834 
5 28.08485 84.66917 1.534595 
6 29.88148 84.66917 1.532505 

以前、私は以下のコードを使用しています国をラスタポイントに割り当てることができますが、これは国のEEZ内にある多くの海洋地点でNAを返します。

#convert the raster to points for assigning countries 
r.pts <- rasterToPoints(r, spatial = TRUE) 

#view new proj 4 string of spatialpointsdataframe 
proj4string(r.pts) 
##[1] "+proj=longlat +datum=WGS84 +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0" 

###converting reclassified points to countries 
# The single argument to this function, points, is a data.frame in which: 
# - column 1 contains the longitude in degrees 
# - column 2 contains the latitude in degrees 
coords2country = function(r.pts) 
{ 
countriesSP <- getMap(resolution='high') 
#countriesSP <- getMap(resolution='high') #you could use high res map from rworldxtra if you were concerned about detail 

#setting CRS directly to that from rworldmap 
r.pts = SpatialPoints(r.pts, proj4string=CRS(proj4string(countriesSP))) 

# use 'over' to get indices of the Polygons object containing each point 
indices = over(r.pts, countriesSP) 
# return the ADMIN names of each country 
indices$ADMIN 
#indices$ISO3 # returns the ISO3 code 
#indices$continent # returns the continent (6 continent model) 
#indices$REGION # returns the continent (7 continent model) 
} 

#get country names for each pair of points 
rCountries <- coords2country(r.pts) 

同様の機能をcoords2countriesに実行する方法はありますか?しかし、EEZは海にありますか?

EDIT:再現性例えば、いくつかのデータ

dput(head(r.pts)) 
structure(list(layer = c(5, 5, 5, 5, 5, 5), x = c(-178.311660375408,-176.511660375408, -174.711660375408, -172.911660375408, -171.111660375408,-169.311660375408), y = c(73.1088933113454, 73.1088933113454,73.1088933113454, 73.1088933113454, 73.1088933113454, 73.1088933113454),.Names = c("layer", "x", "y"),row.names = c(NA, 6L), class = "data.frame") 
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申し訳ありませんが、私はデータのサブセットして上記行った再現 –

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のサンプルデータの 'dput()を'てください。 –

答えて

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あなたはEEZsが含まれてシェープファイルを必要としています。あなたはrgdalパッケージからreadOGR()機能をEEZのシェープファイルを読み込むことができます世界のEEZのV9(2016年10月21日、123メガバイト)http://www.marineregions.org/downloads.php#marbound

:ここにあるものをダウンロードしてください。 EEZ shapefile zipを作業ディレクトリに解凍し、countriesSP <- getMap(resolution='high')の代わりに

のいずれかのデータを入力します。これは実際に動作するかどうかはわかりませんが、おそらくそれは... 。

library(sp) 
library(rworldmap) 
library(rgeos) 

r <- read.table(header = TRUE, text = " 
long lat Aragonite 
1 20.89833 84.66917 1.542071 
2 22.69496 84.66917 1.538187 
3 24.49159 84.66917 1.537830 
4 26.28822 84.66917 1.534834 
5 28.08485 84.66917 1.534595 
6 29.88148 84.66917 1.532505 
") 
# or 
#r <- data.frame(long = c(-178.311660375408,-176.511660375408, -174.711660375408, -172.911660375408, -171.111660375408,-169.311660375408), 
#    lat = c(73.1088933113454, 73.1088933113454,73.1088933113454, 73.1088933113454, 73.1088933113454, 73.1088933113454)) 

r.pts <- sp::SpatialPoints(r) 

# download file from here: http://www.marineregions.org/download_file.php?fn=v9_20161021 
# put the zip file in your working directory: getwd() 
unzip('World_EEZ_v9_20161021.zip') 

# countriesSP <- rworldmap::getMap(resolution = "high") 
# or 
countriesSP <- rgdal::readOGR(dsn = ".", layer = "eez_boundaries") 

r.pts <- sp::SpatialPoints(r.pts, proj4string = sp::CRS(proj4string(countriesSP))) 
indices <- over(r.pts, countriesSP) 
indices$ADMIN 
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