ggplot2を使用して、elcapitanを実行しているMacにフォレストプロットを作成しています。 背景に淡い縦線があります。これはグリッド線ではありません。これは「テーマ」の設定です:プロットggplot2の背景にアーチファクトグレーの線があります。grid.arrange R Mac OSx石英
theme_set(theme_bw())
theme_update(
axis.line = element_line(colour = "black"),
axis.line.y=element_line(colour="white"),
panel.grid.major = element_blank(),
panel.grid.minor = element_blank(),
panel.border = element_blank(),
panel.background = element_blank(),
axis.text.y = element_blank(),
axis.ticks.y = element_blank(),
plot.margin = unit(c(0,0,0,0), "lines")
)
これらの灰色の線を取り除く方法に関するアイデアはありますか? このボードとRとggplot2の初心者です - サンプルデータと私のコードをロードするのは楽しいですが、ここで役に立つかどうかは分かりません。
プロットのスクリーンショット:
コードのためのサンディエゴの質問に応答したUPDATE:
このコードは、Mattの統計からコードやものに基づいていた - https://mcfromnz.wordpress.com/2012/11/06/forest-plots-in-r-ggplot-with-side-table/ - 私彼の元のコードへのリンクを見つけることができません。
theme_set(theme_bw())
theme_update(
axis.line = element_line(colour = "black"),
axis.line.y=element_line(colour="white"),
panel.grid.major = element_blank(),
panel.grid.minor = element_blank(),
panel.border = element_blank(),
panel.background = element_blank(),
axis.text.y = element_blank(),
axis.ticks.y = element_blank(),
plot.margin = unit(c(0,0,0,0), "lines")
)
pD<- ggplot(datD,aes(cen,rev(author2))) +
geom_point(aes(fill = summary), size=1.7,shape=23,colour="black") +
geom_errorbarh(
aes(xmax = datD$high, xmin = datD$low, colour=summary),
height = 0.3, size=0.25) +
scale_x_continuous(
breaks = seq(0,1,.1), labels = seq(0,100,10)) +
labs(x="Risk, %", y="") +
theme(axis.text.x=element_text(size=2))+geom_text(aes(0, author2), label=(paste(rev(datD$author2),rev(datD$risk))), hjust=0, size=ifelse(rev(datD$author2)=="Heterogeneity (95% CI)",2,0), fontface="bold")
p2D<-pD+
theme(legend.position = "none",
axis.text.x = element_text(size=6),
axis.title = element_text(size=6,face="italic")) +
guides(size = FALSE) +
geom_hline(aes(yintercept=c((length(datD$authorREF2)-0.5))))
#Left hand side will be author_yr, Events, Participants
#V0 indicates how many y-axis datapoints there willbe
#V05 spaces out the table columns on the x-axis
#V1 is a vector of all the columns that will be in the table
lab_left1D<-data.frame(
V0 = factor(
c(as.factor(1:length(datD$authorREF2))),
levels=c(as.factor(length(datD$authorREF2):1))
),
V05 = rep(
c(1,1.25,1.5,1.7),
each=length(datD$authorREF2)
),
V1 = c(c(as.character(datD$authorREF2)),
c(as.character(datD$Events)),
c(as.character(datD$patients)),
c(as.character(datD$risk))))
data_table_left1D<-ggplot(lab_left1D,
aes(x = V05, y = V0,
label = format(V1, nsmall = 1))) +
geom_text(
aes(fontface =
ifelse(
V0==as.character((length(datD$authorREF2)-1)),'bold.italic',
ifelse(V0=='1','bold',
ifelse(V0==as.character
(length(datD$authorREF2)),'italic','plain')))),
size = ifelse(
lab_left1D$V0==as.character(length(datD$authorREF2)),0,2), hjust=0, vjust=1.3) + theme_bw() +
theme(panel.grid.major = element_blank(),
legend.position = "none",
panel.border = element_blank(),
#axis.line = element_line(colour = "black"),
axis.text.x = element_text(colour="white"),#element_blank(),
axis.text.y = element_blank(),
axis.ticks = element_line(colour="white"),#element_blank(),
plot.margin = unit(c(0.5,0,0,0), "lines")) +
labs(x="",y="") +
coord_cartesian(xlim=c(1,2.5))
grid.arrange(data_table_left1D, p2D,widths=c(5,3))
dev.off()
左側のggplotにはまだ大きなグリッド線が設定されているようです。実際のコードを掲示すれば本当に助けてくれるはずです。私たちは、他にどこに大きなグリッド線が戻ってくるかを紹介しているかもしれません。 – hrbrmstr
私はグリッド線ではないと思います。それはRがどのように石英にレンダリングするかと関係していると思いますMac-- – HanzMoleman
私はMacを使用しています。それは本当に興味深い形式のコードです。あなたが[this](http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible-example)を見たことがあるかどうかはまだ分かりませんが、Rで作業する方法を説明するのに役立ちますSO Q&Aフォーラムのサイド。 – hrbrmstr