python pandas - 参照として2列を使用したマップ

Question

私はPythonに読みたい2つのtxtファイルを持っています：1）地図ファイル、2）データファイル。ルックアップテーブルや辞書に2つの列の値を読み込み、pandas.map関数のようなものを使って3番目の列に入れる値を決定します。実際のマップファイルは〜70万行、実データファイルは〜1000万行です。私はいくつか見つかっ

Chr  Position Name 
1  1000  SNPA 
1  2000  SNPB 
2  1000  SNPC 
2  2001  NaN 

：データは、最終的なテーブルを結果の

Chr  Position 
1  1000 
1  2000 
2  1000 
2  2001 

ファイル -

玩具DATAFRAME（または私は辞書として再作成することができ） - 地図

Chr  Position Name 
1  1000  SNPA 
1  2000  SNPB 
2  1000  SNPC 
2  2000  SNPD 

玩具DATAFRAME 1つの列ルックアップ：Adding a new pandas column with mapped value from a dictionaryでこれに関する質問。しかし、2つの列を使用する方法を見つけることができないようです。私はゲノムデータを扱うことができる他のパッケージにもオープンしています。

ボーナスの第2の質問の場合、マッピングされた値がある程度あれば、3番目の列をマッピングする方法があればいいでしょう。言い換えれば、上の表の4行目はSNPDにマップされます。しかし、私はちょうど上記の解決策を得ることを嬉しく思う。

Answer 1

私はそれをこのようにします：最初の2つのカラムがインデックスになりますように

があなたの地図データを読み込む

：あなたは区切り文字として ,を持っている場合 sep=','へ

dfm = pd.read_csv('/path/to/map.csv', delim_whitespace=True, index_col=[0,1]) 

変更delim_whitespace=True

あなたのDFを読み上げる（同じインデックスを設定する）：

df = pd.read_csv('/path/to/data.csv', delim_whitespace=True, index_col=[0,1]) 

はあなたのDFに参加：

df.join(dfm) 

出力：

In [147]: df.join(dfm) 
Out[147]: 
       Name 
Chr Position 
1 1000  SNPA 
    2000  SNPB 
2 1000  SNPC 
    2001  NaN 

PSボーナスの質問のための私のDFSは異なる列名を持っている場合、私はこれをどのように行うことができますthis