私は森林の異なる地層(ツリーキャノピーと下層)の昆虫の豊富なPCAの一連のバイオプロットを作成しようとしています。私はrda()関数を使ってこれをやっています。プロットを作成するために、私はビーガンのbiplot()
機能を使用して、それへの変更のカップルを行うのです。ビーガンのbiplot()関数で種ラベルのフォントサイズを変更する方法
しかし、私はにいくつかのバイプロットに参加しますので:
Family=read.table("Family2.txt", header=T)
strata=read.table("Strata.txt", header=T)
family.pca=rda(Family)
with(strata, levels(Strata))
biplot(family.pca, type=c("text", "none"), col=c("black", "black"), xlab="",
ylab="")
title(xlab="PC1 (86.8%)", ylab="PC2 (9.7%)", mgp=c(2.2, 2.2, 0))
points=c(16, 1)
colour=c("black", "black")
with(strata, points(family.pca, display = "sites", col = colour, pch =
points))
with(strata, legend("topright", legend = levels(Strata), bty = "n", col =
colour, pch = points, pt.bg = points))
結果はかなりいいです大きなグラフでは、家族のラベル(通常は「種ラベル」と呼ばれます)が小さすぎます。私はbiplot()
のcex=1.5
を使ってそれらを変更しようとしましたが、その機能のデフォルトによって上書きされているようです。 type=c("none", "none")
を設定して空のバイプロットフレームを作成すると、text()
関数を使用して、より大きな種のラベルを追加できます。
text(family.pca, display = "species", cex = 1.0, col = "black")
が、その後、私は(私は本当に...そこに矢を持っていると思います)プロットに矢印を追加する方法を知りません。
このケースの解決策を知っている人はいますか?回答は非常に高く評価されています。