IPythonノートブックでrpy2を使用していますか？

Question

IPythonノートブックでrpy2（ggplot2を呼び出す）を使用して保存できますか（他のノートブックと同様にNBViewerで共有します）http://nbviewer.ipython.org/？ rpy2 ggplotsをノートブックやインタラクティブに表示させることに問題はありますか？誰かが例セッションと、IPythonでrpy2を使ってノートブック内でggplot2を作るという出力を提供できるなら、助けになるでしょう。

Answer 1

rpy2を使用するrmagic拡張機能で可能です。あなたはprint()の図を表示する必要があるようですが、セッションの例を次に示します。http://nbviewer.ipython.org/5029692

rpy2を直接使用する場合は、それが可能である必要があります。 rpy2 documentation for ggplot2をご覧ください。ノートブックに取り込むには、PNG/SVGデバイスに描画し、Python側から読み込みます（これはrmagicの機能です）。

Answer 2

これはrmagicのコードを見ずに書かれています。 彼らはそれをもっと賢明な方法で持っています（私は11行のコードを持っています）。

import uuid 
from rpy2.robjects.packages import importr 
from IPython.core.display import Image 

grdevices = importr('grDevices') 
def ggplot_notebook(gg, width = 800, height = 600): 
    fn = '{uuid}.png'.format(uuid = uuid.uuid4()) 
    grdevices.png(fn, width = width, height = height) 
    gg.plot() 
    grdevices.dev_off() 
    return Image(filename=fn) 

それを試して：

from rpy2.robjects.lib import ggplot2 
from rpy2.robjects import Formula 
datasets = importr('datasets') 
mtcars = datasets.__rdata__.fetch('mtcars')['mtcars'] 
p = ggplot2.ggplot(mtcars) + \ 
    ggplot2.aes_string(x='mpg', y='cyl') + \ 
    ggplot2.geom_point() + \ 
    ggplot2.geom_smooth() + \ 
    ggplot2.facet_wrap(Formula('~ am')) 

ggplot_notebook(p, height=300)