bioconda：そのようなファイルやディレクトリはありませんビルド

Question

私はbioconda用の新しいパッケージ（verifybamid）を構築しようとしています。私はドッカー、コンドーム、bioconda-utilsなどを設定した最小限のLinux VMでこれを実行しています。 conda build verifybamidが動作します。私が試してみると、最初は正常に動作しますが、最終的にはtest_package（）によって呼び出されるNo such file or directory: mulled-buildが返されます。./simulate-travis.py --packages verifybamid --loglevel=debugbioconda-utilsによると：

それぞれ内蔵されたパッケージは現在、孤立busyboxのコンテナ混練ビルドとinvolucroに おかげで試験することができます。これにより、 レシピで実行依存関係にlibs（例：libgcc）を指定できない問題が発生します。

しかし、これを動作させるにはどのパッケージをインストールする必要がありますか？

おかげで、あなたは銀河-LIBをインストールする必要が アンドレアス

Answer 1

。実際には、requiremets.txtファイルにはbioconda-utilsの依存関係が必要です。そうでない場合conda install galaxy-libを実行してください。あなたはCondaパッケージから非常に効率的なDockerコンテナを作成するためにmulled-buildを取得します。

乾杯、 Bjoern