機械化を使用してさまざまなウェブサイトからデータを収集しようとしています。機械化エラー - Python
No handlers could be found for logger "mechanize"
このエラーは、エラーが発生した場所の特定の場所を示していないため、デバッグが非常に困難です。私はオンラインで見て、機械化バージョン0.1.11がこの問題を解決したことを見てきました。私は機械化の新しいバージョンをダウンロードし、これはもはや問題ではないはずだと想像します。この問題を引き起こす私のコードは
def KEGG(textfile):
KEGGString = ''
KEGGList = []
original = open('Final.txt', 'r')
for row in original:
data = re.split("(#|\t)", row) ##splits text files by tabs into separate strings
new_items = [x if x!='\t' else 'None' for x in data] ##replaces extra tabs with "None"
KEGGList.append(new_items[-1])
KEGGHeaderless = KEGGList[1:] ## Removes header (Cross-Reference (KEGG)) from the list.
KEGGHeaderless = [s.replace(';', '') for s in KEGGHeaderless]
fo = open('KEGG Description.txt', 'w')
for row in KEGGHeaderless:
geneID = row
base2 = 'http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?'
url = base2 + geneID
br = Browser()
br.set_handle_robots(False)
br.open(url)
for line in KEGGHeaderless:
targetURL = '/dbget-bin/get_linkdb?-t+pathway+' + row
try:
site = br.follow_link(url=targetURL)
br.open(site)
page = br.response().read()
fo.write(page)
except:
fo.write(line + "None\n")
fo.close()
どのようにこの問題を解決するための提案?
ありがとうございます!それはうまくいった。 – Marea