ログスケールを使用するようggpairsに指示できますか？

Question

GGallyパッケージのggpairs関数にパラメータを指定して、すべてではない変数の一部にログスケールを使用できますか？

Answer 1

次のようなパラメータを提供することはできません（理由は散布図を作成する機能がスケールすることなく、事前に定義されていることで、ggally_pointsを参照）、しかし、あなたはgetPlotとputPlotを使用して、後でスケールを変更することができます。例：

custom_scale <- ggpairs(data.frame(x=exp(rnorm(1000)), y=rnorm(1000)), 
upper=list(continuous='points'), lower=list(continuous='points')) 
subplot <- getPlot(custom_scale, 1, 2) # retrieve the top left chart 
subplotNew <- subplot + scale_y_log10() # change the scale to log 
subplotNew$type <- 'logcontinuous' # otherwise ggpairs comes back to a fixed scale 
subplotNew$subType <- 'logpoints' 
custom_scale <- putPlot(custom_fill, subplotNew, 1, 2) 

Answer 2

これは本質的にJean-Robertと同じ回答ですが、はるかにシンプル（近づきやすい）です。私はそれが新しい機能であるかどうかわかりませんが、getPlotまたはputPlotをもう使用する必要がないようです。ここで

custom_scale[1,2]<-custom_scale[1,2] + scale_y_log10() + scale_x_log10()

大きなマトリックス全体に適用する機能です。プロットの行数とプロットの名前を指定します。

scalelog2<-function(x=2,g){ #for below diagonal 
for (i in 2:x){ 
    for (j in 1:(i-1)) { 
     g[i,(j)]<-g[i,(j)] + scale_x_continuous(trans='log2') + 
scale_y_continuous(trans='log2') 
         } } 
for (i in 1:x){ #for the bottom row 
     g[(x+1),i]<-g[(x+1),i] + scale_y_continuous(trans='log2') 
         } 
for (i in 1:x){ #for the diagonal 
     g[i,i]<-g[i,i]+ scale_x_continuous(trans='log2') } 
    return(g) }